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红麻WRKY基因家族鉴定及其盐胁迫下的表达分析
文献摘要：
通过鉴定红麻全基因组中WRKY基因家族所有成员,并分析其在盐胁迫下的表达特征,从而为研究WRKY基因家族成员在红麻响应盐胁迫过程中的生物学功能奠定坚实基础.利用生物信息学的方法对红麻全基因组中的WRKY基因家族成员进行鉴定,并对WRKY基因家族各成员的理化性质、系统发育和保守功能域进行分析,同时利用实时荧光定量PCR技术分析盐胁迫下WRKY基因家族各成员的表达特征.结果表明,共鉴定出33个WRKY基因家族成员,且该基因家族成员不均匀地分布在12条染色体上,每个基因家族成员的理化性质如氨基酸数目、分子质量、理论等电点都存在一定的差异,且每个基因家族成员的氨基酸保守序列WRKYGQK没有发生变异.红麻和拟南芥的WRKY基因家族系统进化树分析表明,33个WRKY家族成员分成了3个类群,GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ,其中GroupⅢ包含了5个亚组.实时荧光定量PCR技术分析结果表明,盐胁迫诱导表达的WRKY家族成员有26个,其中23个具有正向调控作用,3个具有负向调控作用.共鉴定出红麻WRKY家族成员33个,其中26个WRKY家族成员参与了红麻盐胁迫响应过程.
文献关键词：
红麻;WRKY;生物信息学;盐胁迫
中图分类号：
作者姓名：
李辉;康泽培;邱财生;戴志刚;邱化蛟
作者机构：
中国农业科学院 麻类研究所,湖南 长沙 410205;湖南文理学院 生命与环境科学学院,湖南 常德 415000
文献出处：
引用格式：
[1]李辉;康泽培;邱财生;戴志刚;邱化蛟-.红麻WRKY基因家族鉴定及其盐胁迫下的表达分析)[J].华北农学报,2022(04):71-81
A类：
B类：
红麻,基因家族鉴定,盐胁迫,表达分析,通过鉴定,全基因组,表达特征,生物学功能,利用生物,系统发育,功能域,分子质量,等电点,保守序列,WRKYGQK,拟南芥,族系,系统进化树分析,类群,Group,诱导表达,胁迫响应,响应过程
AB值：
0.194612
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