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基于全基因组测序平均核苷酸一致性的生胞梭菌(Clostridium sporogenes)鉴定
文献摘要：
基于全基因组测序通过平均核苷酸一致性鉴定生胞梭菌(Clostridium sporogenes)CICC 10385(=CMCC 64941)至种水平.通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 10385的基础信息,并采用BGISEQ-500基因测序仪进行全基因组测序分析全基因组平均核苷酸一致性.结果显示,菌株CICC 10385的基因组大小为4252276 bp,含有58个contigs,基因组(G+C)mol％为27.9％.该菌16S rRNA基因序列与生胞梭菌(C.sporogenes)、肉毒梭菌(C.botulinum)、孔氏梭菌(C.combesii)和C.tepidum最为相似,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)分析显示,该菌与生胞梭菌(C.sporogenes)DSM 795T(GCA 001020205.1)ANI值为99.39％,与梭菌属其余菌种ANI值均低于95％,可将CICC 10385鉴定为生胞梭菌(C.sporogenes).基于全基因组测序的ANI分析是一种准确有效的菌种鉴定方法,为该菌及梭菌属(Clostridium sp.)相关菌种鉴定研究提供了理论依据,为该菌的生物学功能研究奠定了基础.
文献关键词：
生胞梭菌;CICC 10385;CMCC 64941;全基因组测序;平均核苷酸一致性
中图分类号：
作者姓名：
曹艳花;冯会粉;程坤;刘波;都海渤;谢九艳;辛迪;姚粟
作者机构：
中国食品发酵工业研究院有限公司 中国工业微生物菌种保藏管理中心,北京,100015
文献出处：
引用格式：
[1]曹艳花;冯会粉;程坤;刘波;都海渤;谢九艳;辛迪;姚粟-.基于全基因组测序平均核苷酸一致性的生胞梭菌(Clostridium sporogenes)鉴定)[J].食品与发酵工业,2022(19):44-49
A类：
生胞梭菌,sporogenes,combesii,tepidum,795T
B类：
平均核苷酸一致性,Clostridium,CICC,CMCC,生理生化特征,基础信息,BGISEQ,基因测序,全基因组测序分析,基因组大小,bp,contigs,G+C,16S,rRNA,基因序列,肉毒梭菌,botulinum,average,nucleotide,identity,ANI,DSM,GCA,确有,菌种鉴定,鉴定方法,鉴定研究,生物学功能,功能研究
AB值：
0.24367
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