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杜仲TCP转录因子鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
目的 对杜仲TCP(teosinte branched 1/cycloidea/proliferating)基因家族进行筛选分析,以期为EuTCPs基因功能深入研究奠定基础.方法 以杜仲基因组数据库为基础,通过生物信息学系统分析TCP基因家族的理化性质、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及其在杜仲叶片发育及胶形成中的表达水平.结果 从杜仲基因组中共鉴定到14个EuTCPs,氨基酸数目介于139～492,理论等电点分布在5.54～9.72,相对分子质量区域为18 880～53 620,亚细胞定位预测在细胞核中,均为亲水性蛋白.系统进化分为PCF、CIN和CYC/TB1 3个亚家族,分别包含5、6、3个EuTCPs蛋白.表达模式分析显示,EuTCPs在杜仲叶片不同发育时期存在显著差异,每个发育时期Eu TCPs表达量各不相同,EuTCPs正调控杜仲胶的形成.结论 杜仲中TCP家族包含14个成员,各成员的分子特征和组织表达特异性存在差异,EuTCPs可能参与杜仲叶片发育及杜仲胶的形成.
文献关键词：
杜仲;TCP转录因子;亚细胞定位;系统进化;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
刘俊;李龙;吴耀松;刘燕;任闪闪;陈玉龙
作者机构：
河南中医药大学中医药科学院河南省中医方证信号传导重点实验室,河南郑州 450046;国际竹藤中心国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京100102;国际竹藤中心安徽太平试验中心,安徽黄山245716;西北农林科技大学林学院,陕西杨凌 712100
文献出处：
引用格式：
[1]刘俊;李龙;吴耀松;刘燕;任闪闪;陈玉龙-.杜仲TCP转录因子鉴定及生物信息学分析)[J].中草药,2022(18):5813-5824
A类：
EuTCPs,TCPs
B类：
生物信息学分析,teosinte,branched,cycloidea,proliferating,基因家族,基因功能,基因组数据,系统进化,基因结构,启动子,顺式作用元件,杜仲叶片,叶片发育,等电点,相对分子质量,亚细胞定位,定位预测,细胞核,亲水性,PCF,CIN,CYC,TB1,亚家族,表达模式分析,不同发育时期,各不相同,正调控,杜仲胶,分子特征,组织表达,达特,表达分析
AB值：
0.310403
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