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曼氏无针乌贼维甲酸X受体(RXR)cDNA的克隆与表达
文献摘要：
维甲酸X受体(retinoid X receptor,RXR)属于配体激活的核受体家族.本研究采用RT-qPCR技术克隆了曼氏无针乌贼RXR(SjRXR)基因的CDS区核酸序列,推导出其氨基酸序列,并对RXR基因CDS区核苷酸序列与蛋白质结构进行了生物信息学分析,结果如下:SjRXR的CDS区核苷酸序列全长1239 bp,编码1个由412个氨基酸组成的蛋白质;序列分析表明,曼氏无针乌贼RXR的CDS区基因编码的蛋白质不含有信号肽,无跨膜结构,推测RXR编码蛋白属于非分泌型、非跨膜蛋白;对蛋白进行疏水性分析,发现亲水性部分大于疏水性部分,预测RXR编码蛋白为亲水性蛋白,包含1个HOL1家族的结构域;利用MEGA 6.0软件以ML法构建了系统进化树,结果表明,曼氏无针乌贼与双斑蛸亲缘关系最近,同属于软体动物门头足纲,最先聚为一支,曼氏无针乌贼RXR基因的分子进化地位与其生物学分类地位大体保持一致.采用RT-qPCR技术分析了该基因在乌贼4个时期11个组织中的表达规律,结果如下:sjRXR 基因在各组织中均有表达,且在肝、胰、脑、视叶和视腺中表达量较高;sjRXR基因表达在不同生长周期存在明显变化,在肝、胰中呈一直上升趋势,在脑、视叶、视腺中呈先上升后下降趋势.SjRXR是曼氏无针乌贼神经发育、生殖调节和衰老凋亡的重要调控因子之一,本研究结果可为进一步深入研究头足类动物RXR基因提供重要参考依据.
文献关键词：
曼氏无针乌贼;RXR;生殖;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
董震宇;杨槐;郭宝英;叶莹莹;祁鹏志;迟长凤;徐开达
作者机构：
浙江海洋大学,浙江舟山316022;国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江舟山316022;浙江省海洋水产研究所,浙江舟山316021;农业农村部重点渔场渔业资源科学观测实验站,浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室,浙江舟山316021
文献出处：
引用格式：
[1]董震宇;杨槐;郭宝英;叶莹莹;祁鹏志;迟长凤;徐开达-.曼氏无针乌贼维甲酸X受体(RXR)cDNA的克隆与表达)[J].中国水产科学,2022(06):814-824
A类：
SjRXR,HOL1,sjRXR
B类：
曼氏无针乌贼,维甲酸,cDNA,克隆与表达,retinoid,receptor,核受体,qPCR,CDS,氨基酸序列,蛋白质结构,生物信息学分析,全长,bp,氨基酸组成,序列分析,基因编码,信号肽,膜结构,编码蛋白,非分,跨膜蛋白,疏水性,亲水性,结构域,MEGA,ML,系统进化树,亲缘关系,同属,软体动物门,门头,头足纲,最先,分子进化,进化地位,分类地位,保持一致,表达规律,不同生长周期,先上,神经发育,衰老,调控因子,头足类,类动物,表达分析
AB值：
0.300553
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