典型文献
甘草Pht1基因家族鉴定与表达分析
文献摘要：
Pht1家族磷酸盐(Pi)转运体介导植物中磷(P)的吸收和再动员.为探讨甘草Pht1基因的结构及表达模式,该研究利用生物信息学方法对甘草Pht1(GuPht1)基因家族进行分析,结合转录组数据和实时荧光定量(qRT-PCR)分析GuPht1在非生物胁迫下的表达,并采用RT-PCR克隆4个GuPht1基因.结果显示:(1)甘草中有8个Pht1家族成员(GuPht1;1—GuPht1;8),都位于细胞膜上,且具有12个跨膜结构,属于MFS超家族,氨基酸长度介于521～570 aa之间,含有Pht1保守的特征序列GGDYPLSATIMSE.(2)系统进化分析显示,甘草GuPht1基因家族成员与豆科植物亲缘关系较近;启动子区含有与磷饥饿有关的W-box、G-box、PHO-like和P1BS元件;甘草GuPht1基因家族在Scaffold定位分布均匀,三级结构均为单体.(3)转录组数据分析显示,GuPht 1响应干旱、盐、激素等胁迫,且表达有组织特异性.qRT-PCR结果表明,低磷胁迫下GuPht1基因有明显的时空表达差异性,Gu-Pht1;1/1;6/1;8在根中表达明显上调,GuPht1;5/1;6在叶中表达明显上调,低磷处理显著提高了GuPht1在根和叶中的表达量,根中被诱导上调表达的成员更多;在干旱、盐、激素处理下根和叶中GuPht1;5都被显著诱导表达.(4)成功克隆甘草 GuPht1;1/1;2/1;4/1;5基因,长度分别为 1 562、1 618、1 625和 1 616 bp,编码522、538、540和537个氨基酸.本研究结果为深入探讨Pht1家族的功能和甘草对营养胁迫的响应机理提供参考.
文献关键词：
甘草;磷转运蛋白;非生物胁迫;基因表达;基因克隆
中图分类号：
作者姓名：
张亚丽;王楠;高静;张岗;李铂;颜永刚
作者机构：
陕西中医药大学药学院,西安712046;陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心/秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育),陕西咸阳712083
文献出处：
引用格式：
[1]张亚丽;王楠;高静;张岗;李铂;颜永刚-.甘草Pht1基因家族鉴定与表达分析)[J].西北植物学报,2022(02):229-241
A类：
Pht1,GuPht1,GGDYPLSATIMSE,GuPht
B类：
甘草,基因家族鉴定,表达分析,磷酸盐,Pi,转运体,表达模式,研究利用,利用生物,生物信息学方法,转录组数据,qRT,非生物胁迫,细胞膜,膜结构,MFS,超家族,aa,特征序列,系统进化分析,豆科植物,亲缘关系,启动子区,磷饥饿,box,PHO,like,P1BS,Scaffold,三级结构,有组织,组织特异性,低磷胁迫,时空表达,表达差异,激素处理,诱导表达,bp,营养胁迫,响应机理,磷转运蛋白,基因克隆
AB值：
0.274237
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