典型文献
CCL2高表达与低级别胶质瘤患者不良预后的相关性
文献摘要:
目的 分析趋化因子配体2(CCL2)与低级别胶质瘤(LGG)不良预后的相关性,构建用于评估LGG患者的CCL2相关基因预后模型.方法 通过GEPIA数据库与TCGA数据库中分别获得TCGA癌症数据以及LGG样本信息.鉴定LGG组织中与CCL2存在共表达关系的基因,并且对这些基因进行KEGG通路与GO功能富集分析、Cox单因素生存分析、蛋白质相互作用网络构建、对潜在预后模型的相关基因筛选并构建风险评分预后模型、对评分模型的预后区分能力评估.结果 总共鉴定了1333个CCL2共表达基因,分析CCL2在LGG中的表达及预后,发现CCL2在LGG中表达显著增强.富集分析结果显示CCL2共表达基因主要集中在免疫相关信号通路.构建了包含31个CCL2相关基因的预后模型,生存分析结果表明,高风险评分与LGG患者的不良预后相关,ROC曲线表明该模型具有良好的准确性.风险评分相关的nomogram的1、3和5年生存率的AUC值分别为0.93、0.91和0.888,显示该模型具有较好的预后区分能力.结论 CCL2高表达与LGG预后不良密切相关,是评估LGG预后的有效指标,本研究成功构建了用于评估LGG患者预后的CCL2相关基因预后模型.
文献关键词:
低级别胶质瘤;CCL2;WGCNA;免疫;预后
中图分类号:
作者姓名:
黄志杰;马月龙;陈雅娟
作者机构:
福建师范大学生命科学学院/细胞逆境响应与代谢调控福建省高校重点实验室,福建 福州 350108
文献出处:
引用格式:
[1]黄志杰;马月龙;陈雅娟-.CCL2高表达与低级别胶质瘤患者不良预后的相关性)[J].医学信息,2022(15):7-13
A类:
B类:
CCL2,低级别胶质瘤,不良预后,趋化因子配体,LGG,预后模型,GEPIA,TCGA,表达关系,功能富集分析,Cox,生存分析,蛋白质相互作用网络,网络构建,基因筛选,风险评分,评分模型,后区,区分能力,能力评估,总共,共表达基因,免疫相关信号通路,nomogram,预后不良,有效指标,WGCNA
AB值:
0.23449
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