典型文献
三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤比较研究
文献摘要：
为了揭示N6-甲基腺嘌呤(6mA)在近缘物种间的分布规律和物种进化过程中的变化,研究在分离2种四膜虫(Tetrahymena malaccensis和Tetrahymena pyriformi)大核的基础上,利用三代测序技术绘制了其全基因组单碱基分辨率6mA图谱,结合公共数据库中已有的模式种Tetrahymena thermophila数据,开展了3种四膜虫比较6mA甲基化组分析,发现:(1)3种四膜虫6mA甲基化位点分布特征类似,包括呈约200 bp周期性分布和具有保守AT基序;(2)6mA主要分布于基因的5'端,在种间直系同源基因上的分布模式具有区域近似性,但在单碱基水平不完全保守;(3)在种内近期复制的并系同源基因中,6mA分布在单碱基水平具有较高的保守性;(4)结合3种四膜虫的分化时间,估算出了四膜虫中6mA动态变化过程,6mA位点建立的速度大约为每Mb每百万年69.9—226个位点.
文献关键词：
全基因组;N6-甲基腺嘌呤;比较甲基化组;保守基因;种特异基因;四膜虫
中图分类号：
作者姓名：
王粟;柴小翠;张晶;杨文涛;袁冬霞;熊杰
作者机构：
大连海洋大学, 大连 116023;中国科学院水生生物研究所, 武汉 430072;中国科学院大学, 北京 100049
文献出处：
引用格式：
[1]王粟;柴小翠;张晶;杨文涛;袁冬霞;熊杰-.三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤比较研究)[J].水生生物学报,2022(04):574-583
A类：
Tetrahymena,malaccensis,pyriformi,thermophila,比较甲基化组,种特异基因
B类：
四膜虫,全基因组,N6,腺嘌呤,6mA,近缘,种间,物种进化,三代测序技术,碱基,公共数据库,甲基化位点,bp,AT,基序,直系同源基因,分布模式,种内,保守性,分化时间,变化过程,Mb,每百,百万年,个位,保守基因
AB值：
0.247762
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