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典型文献
硫黄素T与侧翼连接双链DNA的G-四链体高特异性作用
文献摘要:
富G碱基的DNA序列在离子诱导下可形成G-四链体(G4),基于这一构型转化设计了大量的传感检测平台.其中的荧光检测平台是基于G4与荧光小分子的相互作用.但是,G4与荧光小分子的有效结合依赖于G4构型和体系中存在的离子种类和离子浓度,尤其是高Na+浓度(140 mmol·L-1).那么如何实现G4与荧光小分子普适性地有效结合,并不依赖于体系中的Na+和Na+浓度,是一个难题.在本研究中,以最简单的富G DNA序列凝血酶适体链TBA(thrombin binding aptamer)为例,在3'端和5'端分别增加10个碱基(TBA-10 bp),K+诱导TBA-10 bp形成K+稳定TBA(K+-TBA,G4)并衔接含有10个互补碱基对的双链DNA(K+-TBA-10 bp).相较于K+-TBA,硫磺素T与K+-TBA-10 bp结合后的荧光强度增加了100倍,相互作用强度增加了 1000倍,而且与体系中的Na+(5-140 mmol·L-1)无关.结合荧光光谱,紫外吸收光谱和圆二色光谱发现硫磺素T特异性的嵌合于K+-TBA和双链DNA衔接处的空腔内.有趣的是,这一结合模式不受G4构型的影响.该研究结果为研究G4与荧光小分子的有效结合提供了新视角,也为拓展G4在生物功能和生化检测领域的应用提供了实验依据.
文献关键词:
硫磺素T;G-四链体;钾离子;钠离子;双链DNA
作者姓名:
周蔚;李运超;范楼珍;李晓宏
作者机构:
北京师范大学化学学院,北京100875
文献出处:
引用格式:
[1]周蔚;李运超;范楼珍;李晓宏-.硫黄素T与侧翼连接双链DNA的G-四链体高特异性作用)[J].物理化学学报,2022(04):76-83
A类:
B类:
硫黄,黄素,侧翼,双链,四链,G4,构型转化,转化设计,传感检测,检测平台,荧光检测,小分子,有效结合,离子浓度,Na+,不依,凝血酶,TBA,thrombin,binding,aptamer,bp,K+,碱基对,硫磺,荧光强度,相互作用强度,荧光光谱,紫外吸收光谱,圆二色光谱,嵌合,空腔,有趣,结合模式,生物功能,生化检测,检测领域,钾离子,钠离子
AB值:
0.350106
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