典型文献
基于线粒体基因组的鲹科鱼类进化分析
文献摘要：
用生物信息学方法研究了鲈形目鲹科(Carangidae)鲹亚科、鲳鲹亚科和鰤亚科中33种鱼的线粒体基因组,分别使用Clustal X、MEGA X和DnaSP5.0软件进行核酸序列比对,碱基组成及核酸多样性分析和构建系统进化树.结果表明:1)33种鲹科鱼类线粒体基因组序列全长为16 530～16 609 bp,总的简约信息位点共6 297个,变异位点共7 072个(占42.0％);核苷酸组成A+T的含量占53.8％,大于G+C含量,呈AT偏向性;转换/颠换比值(R)1613/1026;2)33种鲹科鱼类种间遗传距离平均值为0.183;种间遗传距离最大值为卵形鲳鲹(Tra-chinotus ovatus)与高体若鲹(Carangoides equula)间的0.250,最小值为黑纹小条鰤(Seriolina nigrofasciata)与白舌尾甲鲹(Uraspis helvola)间的0.002;3)卵形鲳鲹与鲳鲹属外物种的遗传距离最大,平均值为0.229,泰勃圆鲹(Decapterus tabl)与其他鲹科鱼类平均遗传距离最小为0.170;4)若鲹属的高体若鲹与圆鲹属、竹筴鱼属聚为一支,与同属甲若鲹(Carangoides armatus)和马拉巴若鲹(Carangoides malabaricus)亲缘关系较远.鲳鲹属在进化上与其他鲹科鱼类分化较大,圆鲹属与其他鲹科鱼类遗传距离更近,在线粒体基因组水平上高体若鲹与圆鲹属鱼类亲缘关系更近,与传统分类结果存在差异.
文献关键词：
线粒体DNA;鲹科鱼类;系统进化
中图分类号：
作者姓名：
王海山;蒋欢;陈治;杨超杰;叶乐
作者机构：
海南热带海洋学院水产与生命学院,海南三亚572022;宁波大学海洋学院,浙江宁波315211
文献出处：
引用格式：
[1]王海山;蒋欢;陈治;杨超杰;叶乐-.基于线粒体基因组的鲹科鱼类进化分析)[J].水产学杂志,2022(02):14-20
A类：
Carangidae,DnaSP5,chinotus,Carangoides,equula,黑纹,Seriolina,nigrofasciata,Uraspis,helvola,tabl,malabaricus
B类：
线粒体基因组,鲹科鱼类,进化分析,生物信息学方法,鲈形目,亚科,Clustal,MEGA,序列比对,碱基组成,多样性分析,建系,系统进化树,基因组序列,全长,bp,简约,变异位点,A+T,G+C,AT,偏向性,种间,遗传距离,卵形鲳鲹,Tra,ovatus,最小值,外物,Decapterus,同属,armatus,马拉,拉巴,亲缘关系,较远
AB值：
0.291167
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