典型文献
蔗茅EfMYB1基因的克隆与表达分析
文献摘要：
为了充分利用蔗茅(Erianthus fulvus)野生资源,挖掘其优良的抗性基因,丰富转基因甘蔗育种候选基因库,该研究结合蔗茅转录组数据,以蔗茅99-1无性系为试验材料,利用RT-PCR技术克隆蔗茅MYB基因,并对其进行生物信息学分析及胁迫表达分析,以解析蔗茅的耐寒机理,为转基因甘蔗育种奠定理论基础.结果表明:(1)成功克隆得到一个蔗茅MYB基因,命名为EfMYB1基因(登录号ON586646).(2)生物信息学分析表明,EfMYB1基因全长1000 bp,ORF为759 bp,编码251个氨基酸;编码蛋白具有一个保守的SANT结构域,无跨膜结构和信号肽,有多个磷酸化位点;二级结构与三级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;与南荻相似性最高,遗传距离最近.(3)qRT-PCR分析结果发现,EfMYB1基因在蔗茅根和叶组织中的相对表达量随低温胁迫时间的持续而逐渐显著上调,并于胁迫72 h时达到最大值,而在茎中的表达则几乎没有变化;茉莉酸甲酯胁迫下,EfMYB1基因的相对表达量呈先升高后降低的趋势,且在处理6 h时达到最高值;脱落酸胁迫下EfMYB1基因的表达水平较0 h时极显著降低.研究认为,EfMYB1基因属于低温胁迫响应基因,可能参与蔗茅低温胁迫下的应答反应.
文献关键词：
蔗茅;EfMYB1基因;基因克隆;耐寒;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
饶席兵;钱禛锋;张蓉琼;何丽莲;李富生
作者机构：
云南省作物生产与智慧农业重点实验室,昆明 650201;云南农业大学农学与生物技术学院,昆明 650201;云南农业大学 甘蔗研究所,昆明 650201
文献出处：
引用格式：
[1]饶席兵;钱禛锋;张蓉琼;何丽莲;李富生-.蔗茅EfMYB1基因的克隆与表达分析)[J].西北植物学报,2022(09):1487-1494
A类：
EfMYB1,fulvus,ON586646
B类：
蔗茅,克隆与表达,表达分析,Erianthus,野生资源,抗性基因,转基因,甘蔗,育种,候选基因,基因库,转录组数据,无性系,生物信息学分析,耐寒,登录号,全长,bp,ORF,编码蛋白,SANT,结构域,膜结构,信号肽,磷酸化,二级结构,三级结构,无规则,卷曲,南荻,遗传距离,qRT,相对表达量,有变,茉莉酸甲酯,最高值,脱落酸,酸胁迫,低温胁迫响应,响应基因,应答反应,基因克隆
AB值：
0.31287
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