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刺葡萄白藜芦醇合成酶基因对不同光质的响应及转录因子筛选
文献摘要：
为探究白藜芦醇合成酶基因(RS)的表达模式和转录调控特征,该研究以刺葡萄愈伤组织为材料,采用RT-PCR方法进行RS1基因克隆,分析RS1基因在8种不同光质培养条件下的表达模式,并对靶向RS1的转录因子进行预测分析和筛选验证.结果表明:(1)成功从刺葡萄中克隆获得RS1基因(GenBank登录号为OM339527);RS1基因开放阅读框为1179 bp,由2个外显子和1个内含子组成,编码392个氨基酸,为亲水性无信号肽的细胞质定位蛋白,磷酸化修饰主要发生于苏氨酸和丝氨酸位点上,蛋白质的二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成.(2)RS1启动子具有多个光响应和转录因子识别与结合元件,还涉及激素调控、生长发育、环境条件响应.(3)转录调控预测发现,靶向RS1的转录因子来自9个家族,共有23个成员,其中MYB和Dof基因家族具有多个成员和RS1启动子结合位点.(4)共线性分析表明,葡萄与毛果杨的共线性最高,MYB-DIV和Dof5.1具有多个共线基因.(5)转录水平分析显示,长波光促进RS1的表达,在不同光质和培养阶段下MYB-DIV与靶基因RS1具有相同的表达模式,而Dof5.1的表达模式与RS1呈相反趋势,表明MYB-DIV和Dof5.1分别通过正负调控参与RS1的转录表达.
文献关键词：
刺葡萄;白藜芦醇;光质;转录因子;RS;MYB
中图分类号：
作者姓名：
赖恭梯;阙秋霞;赖谱富;高慧颖;王琦;赖呈纯
作者机构：
福建省农业科学院农业工程技术研究所,福州 350003;福建省农产品(食品)加工重点实验室,福州 350003
文献出处：
引用格式：
[1]赖恭梯;阙秋霞;赖谱富;高慧颖;王琦;赖呈纯-.刺葡萄白藜芦醇合成酶基因对不同光质的响应及转录因子筛选)[J].西北植物学报,2022(07):1113-1123
A类：
OM339527,胞质定位,Dof5
B类：
刺葡萄,白藜芦醇,合成酶基,酶基因,因子筛选,表达模式,转录调控,愈伤组织,RS1,基因克隆,光质培养,培养条件,对靶,预测分析,GenBank,登录号,开放阅读框,bp,外显子,内含子,子组,亲水性,信号肽,细胞质,磷酸化修饰,苏氨酸,丝氨酸,酸位点,二级结构,无规则,卷曲,启动子,光响应,激素调控,MYB,基因家族,结合位点,共线性分析,毛果杨,DIV,转录水平,水平分析,长波,波光,靶基因,正负,负调控,转录表达
AB值：
0.309369
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