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典型文献
基于网络药理学探讨黄芪、丹参治疗冠状动脉痉挛的活性成分与分子机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学探讨黄芪、丹参治疗冠状动脉痉挛的活性成分与分子机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出黄芪、丹参有效成分及相关靶点,将结果导入CytoScape 3.8.2绘制药物-有效成分-靶点网络图,使用其内置Network Analyzer工具对节点的网络拓扑参数分析并筛选出主要有效成分;通过基因名片(GeneCards)数据库筛选冠状动脉痉挛相关靶点并于在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DRUGBANK数据库中检索相关靶点予以补充;通过在线工具构建Venn图并得到黄芪、丹参-冠状动脉痉挛交集靶点,将靶点导入STRING平台构建PPI网络,得到的网络模型通过CytoScape 3.8.2进一步处理得到最终网络模型,使用其内置Network Analyzer工具对节点的网络拓扑参数筛选出主要作用靶点;通过Metascape数据库对主要作用靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;使用AutoDock Vina对主要有效成分及核心靶点进行分子对接验证.结果 黄芪、丹参治疗冠状动脉痉挛的主要有效成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素等;核心靶点为蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤抑制蛋白p53(TP53)、白细胞介素6(IL6)等;涉及的主要通路为晚期糖基化终末产物(AGE)-糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路及流体剪切应力与动脉粥样硬化通路等.分子对接验证中平均对接亲和力为-32.604 kJ/mol.结论 黄芪、丹参治疗冠状动脉痉挛的作用机制具有多成分、多靶点、多通路的特点,为之后基础研究提供了方向.
文献关键词:
冠状动脉痉挛;丹参;黄芪;网络药理学
作者姓名:
曲信彦;高群;潘熠;冯汝丽;谢龙;靳嘉麟;徐江林;曲文白;马征;林谦
作者机构:
北京中医药大学东直门医院 北京 100007;北京积水潭医院;浙江省中医院
引用格式:
[1]曲信彦;高群;潘熠;冯汝丽;谢龙;靳嘉麟;徐江林;曲文白;马征;林谦-.基于网络药理学探讨黄芪、丹参治疗冠状动脉痉挛的活性成分与分子机制)[J].中西医结合心脑血管病杂志,2022(15):2701-2709
A类:
B类:
网络药理学,黄芪,丹参,冠状动脉痉挛,活性成分,系统药理学,分析平台,TCMSP,有效成分,CytoScape,制药,靶点网络,网络图,内置,Network,Analyzer,网络拓扑参数,参数分析,名片,GeneCards,线人,孟德尔遗传,OMIM,DRUGBANK,Venn,交集靶点,STRING,平台构建,PPI,理得,参数筛选,作用靶点,Metascape,基因本体,京都基因与基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock,Vina,核心靶点,分子对接,槲皮素,山奈酚,木犀草素,蛋白激酶,B1,AKT1,肿瘤抑制,p53,TP53,IL6,晚期糖基化终末产物,糖基化终末产物受体,RAGE,流体剪切应力,动脉粥样硬化,中平,接亲,亲和力,kJ,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.318624
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