典型文献
桃XTH家族基因鉴定及其在桃果实贮藏过程中的表达特性
文献摘要：
[目的]通过桃木葡聚糖内糖基转移/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因家族鉴定与不同肉质桃贮藏过程中相关基因的表达分析,发掘PpXTHs家族成员中参与桃果实软化的重要候选基因,为深入解析PpXTHs在果实采后贮藏过程中的功能研究奠定基础.[方法]根据XTH蛋白保守结构域Glyco_hydro_16 domain和XET_C domain,利用Hmmer 3.1软件对桃蛋白质数据库进行搜索,鉴定桃XTH基因家族成员;利用在线软件ProtParam预测其分子量、理论等电点等理化性质;利用在线分析工具Plant-mPLoc预测其亚细胞定位;MEGA11软件构建系统进化树;运用在线工具MEME对其保守motif进行分析,Tbtools呈现蛋白保守结构域和基因结构图谱;MapChart软件绘制基因在染色体上的分布图;利用实时荧光定量PCR(quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)技术检测PpXTHs在不同肉质桃贮藏过程中的表达特性.[结果]在桃基因组共鉴定XTH基因家族成员27个,分布在7条染色体上.系统进化树显示,PpXTHs家族成员可分为祖先类群、Ⅰ/Ⅱ亚家族以及ⅢA和ⅢB亚家族.蛋白结构域分析显示所有PpXTHs成员均含有Glyco_hydro_16和XET_C两个蛋白保守结构域.qRT-PCR结果表明,属于ⅢB亚家族的PpXTH33随着溶质桃贮藏期延长,表达量上调,且表达量显著高于同期硬质桃贮藏过程的表达水平;PpXTH33克隆测序结果显示其CDS序列与桃参考基因组一致,长度为924 bp,编码307个氨基酸;激光共聚焦显微镜观察发现PpXTH33与GFP融合蛋白可能主要于细胞壁与细胞核上产生绿色荧光信号.[结论]桃27个PpXTHs家族成员蛋白结构均含有2个XTH蛋白保守结构域,不均匀分布在7条染色体上.PpXTHs在溶质桃和硬质桃贮藏过程中的表达特性显示,PpXTH33与桃采后果实软化密切相关.
文献关键词：
桃;果实软化;XTH基因家族;基因表达;亚细胞定位
中图分类号：
作者姓名：
郭绍雷;许建兰;王晓俊;宿子文;张斌斌;马瑞娟;俞明亮
作者机构：
江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,南京 210014;南京农业大学园艺学院,南京 210095
文献出处：
引用格式：
[1]郭绍雷;许建兰;王晓俊;宿子文;张斌斌;马瑞娟;俞明亮-.桃XTH家族基因鉴定及其在桃果实贮藏过程中的表达特性)[J].中国农业科学,2022(23):4702-4716
A类：
endotransglucosylase,PpXTHs,XET,Hmmer,mPLoc,Tbtools,MapChart,PpXTH33
B类：
家族基因,基因鉴定,桃果实,果实贮藏,表达特性,桃木,木葡聚糖,糖基,水解酶,xyloglucan,hydrolase,基因家族鉴定,肉质,表达分析,果实软化,重要候选基因,采后贮藏,功能研究,保守结构域,Glyco,domain,蛋白质数据库,ProtParam,分子量,等电点,在线分析工具,Plant,亚细胞定位,MEGA11,软件构建,建系,系统进化树,MEME,motif,基因结构,结构图谱,基因在染色体上,分布图,quantitative,reverse,transcription,qRT,祖先,类群,亚家族,蛋白结构域,溶质,贮藏期,硬质,克隆测序,CDS,参考基因,bp,激光共聚焦显微镜,观察发现,GFP,融合蛋白,细胞壁,细胞核,荧光信号,不均匀分布
AB值：
0.299999
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
