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典型文献
1998-2021年我国人感染H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化规律
文献摘要:
[目的]通过分析1998—2021年间我国人感染H9N2亚型禽流感病例的发病时间、所在省份、年龄和性别等信息,明确H9N2亚型禽流感病毒的流行病学特征;通过分析人源H9N2亚型禽流感病毒的基因特征,阐明人源H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化规律;为H9N2亚型禽流感病毒跨种间传播的预警和防控提供数据支撑.[方法]基于流感基因数据库、病例报道和文献资料,获得1998—2021年我国人感染H9N2亚型禽流感病毒的病例信息和毒株序列数据.从时间、空间、性别和年龄的分布对感染病例进行分析,明确人源H9N2亚型禽流感病毒感染的流行病学特征.通过DNASTAR中的MegAlign软件对人源H9N2病毒的各基因片段的核苷酸序列进行同源性分析,利用MEGA7.0软件构建系统进化树和分析病毒蛋白关键位点,揭示遗传演化趋势和病毒蛋白关键氨基酸位点的变异情况.通过GISAID网站下载2019—2021年间我国H9N2亚型禽流感病毒的核苷酸序列,利用mafft比对后在MEGA7.0中查看人源与禽源H9N2病毒关键氨基酸位点的突变差异,揭示当前人源和禽源H9N2病毒可能引起的风险.[结果]1998—2021年我国人感染H9N2亚型禽流感病毒病例共71例,从空间分布分析,病例分布于16个省市,其中91.55%的病例来自于南方12个省市;从时间分布分析,2013年以后,我国报道的感染病例呈增长趋势,2013—2021年累计感染病例数占总病例数的61.97%;从性别和年龄分布分析,男、女性别比为1﹕1.68,感染病例主要见于幼儿和少儿,占总病例的74.14%.对人源H9N2病毒进行基因组比对分析,发现这些病毒均属于欧亚分支,但是这些病毒各基因片段的核苷酸序列同源性差异较大,HA、NA、PB2、PB1、PA、NP、M和NS的同源性分别为75.3%—100%、80.1%—100%、78.7%—100%、82.5%—100%、72.6%—100%、74.1%—100%、65.5%—100%、82.0%—100%;22株具有完整基因片段的病毒分为8个基因型,2003、2008和2013年的基因型与1999年的基因型有明显差异.1998—2021年共有42株人源H9N2病毒株上传HA序列,其中有38株病毒的HA蛋白发生Q226L的突变;共有30株人源H9N2病毒株上传PB2序列,其中9株病毒的PB2蛋白发生E627V突变,1株病毒的PB2蛋白发生E627K突变;1株病毒的PB2蛋白的701位点发生D701N突变,共有31株人源H9N2病毒株上传NS与M序列,NS1蛋白的42位点均为S,M1蛋白的30和215位点的氨基酸分别为D和A.2019-2021年人源H9N2病毒的HA蛋白183与190位点、NS1蛋白42位点均发生突变,人源与禽源H9N2病毒的PB2蛋白701位点均未发生突变.[结论]自2013年以来,我国人感染H9N2亚型禽流感病例数量呈增长趋势,且具有显著的地域、年龄和性别差异.1998年至今,人源H9N2病毒的基因同源性差异较大,不同分支间病毒基因重排频繁,形成了复杂的基因型,提示H9N2亚型禽流感病毒在不断地进化.人源H9N2病毒的关键氨基酸位点出现突变,且在2019—2021年人源比禽源H9N2病毒的关键位点突变率高,提示H9N2亚型禽流感病毒的跨种感染人的潜力逐渐增强.该结果丰富了对人源H9N2病毒认知,为H9N2亚型禽流感病毒防控提供参考.
文献关键词:
禽流感病毒;H9N2亚型;流行病学;遗传进化;跨种间传播
作者姓名:
王艳文;王梦静;张虹;高鑫鑫;郭晶;李旭勇
作者机构:
聊城大学农学院,山东聊城 252000
文献出处:
引用格式:
[1]王艳文;王梦静;张虹;高鑫鑫;郭晶;李旭勇-.1998-2021年我国人感染H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化规律)[J].中国农业科学,2022(20):4075-4090
A类:
mafft,Q226L,E627V,E627K,D701N,跨种感染
B类:
H9N2,禽流感病毒,遗传演化,演化规律,发病时间,流行病学特征,基因特征,明人,跨种间传播,基因数据库,病例报道,病例信息,毒株,序列数据,感染病,流感病毒感染,DNASTAR,MegAlign,行同,同源性分析,MEGA7,软件构建,建系,系统进化树,病毒蛋白,关键位点,演化趋势,关键氨基酸位点,变异情况,GISAID,站下,下载,查看,病毒病,时间分布,数占,年龄分布,性别比,少儿,比对分析,欧亚,序列同源性,HA,PB2,PB1,PA,NP,基因型,白发,NS1,M1,性别差异,病毒基因,基因重排,位点突变,突变率,病毒防控,遗传进化
AB值:
0.192128
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