典型文献
基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义
文献摘要:
目的 研究GLIS3在胃癌中的表达与预后价值,探索GLIS3在胃癌中免疫细胞浸润情况及其参与的生物学功能.方法 从TCGA数据库中下载胃癌患者GLIS3基因表达谱数据及临床病理信息,比较胃癌组织和癌旁组织中GLIS3的表达差异,分析GLIS3表达与胃癌患者临床病理特征的关系.利用Kaplan-Meier法和Cox回归分析GLIS3表达与胃癌患者临床预后相关性.运用miRWALK、TargetScan及TCGA数据库,预测调控GLIS3异常表达的miRNA.利用GSEA富集分析预测GLIS3在胃癌中可能参与的信号通路.使用TIMER2.0分析GLIS3表达与免疫细胞浸润之间的关系.结果 GLIS3在胃癌组织中表达明显上调,且GLIS3的表达与肿瘤组织学分级相关(P<0.05).生存分析显示GLIS3高表达患者比低表达患者预后更差,差异有统计学意义(P<0.05),是胃癌的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.004~1.653,P<0.05).miR-204-5p在胃癌中表达明显下调,且与GLIS3表达负相关(P<0.05).富集分析结果显示:GLIS3基因主要富集在细胞外基质(ECM)受体相互作用、钙、黏着斑等信号通路.免疫浸润分析结果显示GLIS3表达与CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞相关(P<0.05).结论 GLIS3在胃癌中表达上调,可作为胃癌的诊断和预后的标志物,且与免疫浸润有关.
文献关键词:
胃癌;GLIS3;表达预后;基因集富集分析;免疫浸润;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
王瑞;马腾达;屈才浩;李玉民
作者机构:
兰州大学第二医院普外科,兰州730030;甘肃省消化系肿瘤重点实验室,兰州730030
文献出处:
引用格式:
[1]王瑞;马腾达;屈才浩;李玉民-.基于生物信息学分析GLIS3在胃癌中表达与免疫浸润的临床意义)[J].重庆医学,2022(17):3003-3009,3015
A类:
GLIS3,miRWALK,表达预后
B类:
生物信息学分析,免疫浸润,预后价值,免疫细胞浸润,生物学功能,TCGA,下载,胃癌患者,基因表达谱,谱数据,胃癌组织,癌旁组织,表达差异,临床病理特征,Kaplan,Meier,Cox,临床预后,预后相关性,TargetScan,测调,异常表达,miRNA,GSEA,分析预测,TIMER2,组织中表达,肿瘤组织学分级,生存分析,低表达,独立预后因素,5p,细胞外基质,ECM,黏着斑,CD4+T,巨噬细胞,树突状细胞,诊断和预后,基因集富集分析
AB值:
0.234347
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