采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)ATG5基因cDNA全长,命名为FcATG5.利用实时荧光定量技术分析了 FcATG5的组织表达及其在pH和碳酸盐碱度胁迫下的表达特征,并利用RNAi技术验证其功能.基因分析显示,FcATG5 cDNA全长为2225 bp,开放阅读框为810 bp,编码269个氨基酸,预测其编码的蛋白质分子量为31.103 kDa,理论等电点为5.59,为疏水性蛋白,包含1个APG5自噬相关蛋白结构域,无跨膜结构,不包含信号肽.同源性和系统进化分析显示,FcATG5具有高度保守性,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)同源性最高(98.14％).组织表达分析显示,FcATG5在中国对虾各组织中均有表达,肌肉中表达量最高(P＜0.05),血淋巴细胞中最低(P＜0.05).pH胁迫后48 h,FcATG5在鳃中的表达量最低,为对照组的1.68倍;胁迫后96 h最高,为对照组的2.67倍.碳酸盐碱度胁迫后12 h,FcATG5在鳃中表达量最高,为对照组的2.77倍;胁迫后96h最低,为对照组的1.30倍.干扰实验结果显示,pH和碳酸盐碱度胁迫下,沉默FcATG5基因会使中国对虾死亡率显著增高(P＜0.05),表明该基因的表达量越高,越有利于中国对虾存活.实时定量结果表明,FcATG5在pH、碳酸盐胁迫下的表达量均显著升高(P＜0.05),推测自噬可能参与中国对虾应对非生物胁迫的调控.本研究结果对水生动物特别是甲壳动物中细胞自噬研究具有重要的借鉴意义,有助于推进中国对虾盐碱水养殖的研究进程.

中国对虾;FcATG5;pH胁迫;碳酸盐碱度胁迫;RNAi

魏威;何玉英;李朝霞;周雨欣;李健;谢拥军

青岛农业大学海洋科学与工程学院 山东 青岛 266237;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东 青岛 266071;水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学 上海 201306;河北省水产良种与渔业环境监测保护总站 河北 石家庄 050011

渔业科学进展

[1]魏威;何玉英;李朝霞;周雨欣;李健;谢拥军-.中国对虾ATG5基因的克隆及其在pH、碳酸盐碱度胁迫下的表达分析)[J].渔业科学进展,2022(03):84-94

碳酸盐碱度胁迫,碱度胁迫,FcATG5,APG5

中国对虾,cDNA,RACE,技术获得,Fenneropenaeus,chinensis,全长,定量技术,表达特征,RNAi,技术验证,基因分析,bp,开放阅读框,分子量,kDa,等电点,疏水性,自噬相关蛋白,蛋白结构域,膜结构,信号肽,同源性,系统进化分析,保守性,凡纳滨对虾,Litopenaeus,vannamei,组织表达分析,血淋巴细胞,96h,干扰实验,实时定量,盐胁迫,非生物胁迫,水生动物,甲壳动物,细胞自噬,盐碱水,研究进程

0.206091