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典型文献
草鱼褪黑激素受体Mtnr1基因克隆及组织表达分析
文献摘要:
为了探究褪黑激素受体(melatonin receptor,Mtnr1)基因在草鱼(Ctenopharyngodon idella)中的表达模式和功能,采用RACE技术从草鱼组织中克隆获得Mtnr1基因的6个亚型(Mtnr1Aa、Mtnr1Ab、Mtnr1Alike、Mtnr1Ba、Mtnr1Bb和Mtnr1C)的cDNA序列,采用ProtParam、TMpred、NetPhos、NetNGlyc、Singal4.1及Phyre2等在线软件对Mtnr1基因的6种亚型进行生物信息学分析.同时,通过实时荧光定量PCR检测6种亚型在不同组织中的表达.结果 显示,Mtnr1基因6个亚型cDNA全长分别为2045、2036、2031、2799、2535和2477 bp,分别编码350、351、344、356、347和361个氨基酸.6种亚型均由7个跨膜结构域、NRY结构域、CYICHS结构域和NAXXY结构域及G蛋白偶联受体结合位点组成,同时含有多个磷酸化位点和糖基化位点.Mtnr1基因6个亚型蛋白均由20种氨基酸组成,均属于稳定的亲水性蛋白.氨基酸序列比较分析发现,6种亚型与其他鱼对应的亚型同源性很高,分别为93.1%~99.4%、84.8%~95.2%、82.8%~96.8%、90.1%~97.5%、79.7%~98.3%和90.6%~95.6%.邻接法构建系统进化树显示,6种亚型均与鲤科(Cyprinidae)鱼类聚为一支,与鲤鱼(Cyprinus carpio)、鲫鱼(Carassius auratus)和斑马鱼(Danio rerio)亲缘关系最近.此外,6种亚型mRNA在草鱼肝脏、心脏、鳃、脑、肌肉、前肠、中肠、后肠和肾脏9个组织中均有表达,其中,Mtnr1Aa和Mtnr1Ba基因分别在脑和肾脏中表达量最高,表明Mtnr1Aa和Mtnr1Ba可能在草鱼的神经调节和免疫反应中发挥重要作用.
文献关键词:
褪黑激素受体;草鱼;分子克隆;组织表达
作者姓名:
胡伟;吴慧;袁汉文;郜卫华;陈敦学;郭利伟;许巧情
作者机构:
长江大学 湿地生态与农业利用教育部工程研究中心 湖北荆州 434023;湖南师范大学 省部共建淡水鱼类发育生物国家重点实验室 湖南 长沙410081;贵州大学动物科学学院 贵州 贵阳 550025
文献出处:
引用格式:
[1]胡伟;吴慧;袁汉文;郜卫华;陈敦学;郭利伟;许巧情-.草鱼褪黑激素受体Mtnr1基因克隆及组织表达分析)[J].渔业科学进展,2022(01):141-152
A类:
褪黑激素受体,Mtnr1,Mtnr1Aa,Mtnr1Ab,Mtnr1Alike,Mtnr1Ba,Mtnr1Bb,Mtnr1C,TMpred,Singal4,CYICHS,NAXXY
B类:
草鱼,基因克隆,组织表达分析,melatonin,receptor,Ctenopharyngodon,idella,表达模式,RACE,cDNA,ProtParam,NetPhos,NetNGlyc,Phyre2,生物信息学分析,不同组织,全长,bp,分别编,跨膜结构域,NRY,偶联,结合位点,磷酸化,糖基化位点,氨基酸组成,亲水性,氨基酸序列,序列比较分析,同源性,邻接,接法,建系,系统进化树,鲤科,Cyprinidae,鱼类,类聚,鲤鱼,Cyprinus,carpio,鲫鱼,Carassius,auratus,斑马鱼,Danio,rerio,亲缘关系,鱼肝,中肠,后肠,神经调节,免疫反应,分子克隆
AB值:
0.35999
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