典型文献
X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系
TRAPPC2基因新无义突变的鉴定及分析
文献摘要:
目的:对一个疑似X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)的家系进行临床特征分析和致病基因的筛查,并对可疑变异进行分析,为遗传咨询和产前诊断提供实验依据。方法:采集家系成员病史,一般体检,关节、脊椎X线片检查;收集该家系成员外周血样,提取样本DNA,采用靶向基因高通量测序方法对先证者DNA全外显子进行测序,并对测序数据进行分析;针对可疑突变,采用PCR和Sanger测序对家系其他成员DNA样本进行验证;提取家系成员外周血淋巴细胞的RNA,RT-PCR扩增致病基因外显子3、4区域,琼脂糖凝胶鉴定扩增片段大小;并采用qPCR检测致病基因的表达。结果:根据家系中患者临床表型和脊椎X线片特征,将该家系患者诊断为X-连锁隐性遗传SEDT。全外显子测序检测到先证者转运蛋白复合体亚单位2(trafficking protein particle complex subunit 2,
TRAPPC2)基因NM_001011658:c.91A>T(p.K31*)无义突变,其表弟该基因位点也存在相同变异,家系其他无表型成员未检出该变异。患者外周血淋巴细胞RT-PCR结果与家系正常对照的扩增片段相同,表明该变异不影响转录本的剪接。qPCR结果显示,家系患者
TRAPPC2的转录水平表达较家系正常对照及正常人对照显著降低。
结论:发现
TRAPPC2基因c.91A>T新无义变异,该变异可以导致
TRAPPC2功能丧失,是本家系的致病性变异。
文献关键词:
骨骺;蛋白质基因组学;密码子,无义
中图分类号:
作者姓名:
张闻宇;康可;张玉薇;侯巧芳;秦利涛;刘红彦;郝冰涛;杨科;廖世秀;娄桂予
作者机构:
河南中医药大学第五临床医学院(郑州人民医院)内分泌代谢科,郑州 450002;郑州颐和医院关节与运动医学科(骨三科),郑州 450018;河南省人民医院 医学遗传研究所,郑州 450002
文献出处:
引用格式:
[1]张闻宇;康可;张玉薇;侯巧芳;秦利涛;刘红彦;郝冰涛;杨科;廖世秀;娄桂予-.X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良家系
TRAPPC2基因新无义突变的鉴定及分析
)[J].中华骨科杂志,2022(05):313-319
A类:
TRAPPC2,spondyloepiphyseal,SEDT,91A
B类:
连锁,迟发性,脊椎骨,骨骺,发育不良,良家,家系,无义突变,dysplasia,tarda,临床特征分析,致病基因,可疑,遗传咨询,产前诊断,员外,血样,先证者,序数,Sanger,外周血淋巴细胞,琼脂糖凝胶,qPCR,临床表型,隐性遗传,全外显子测序,转运蛋白,复合体,亚单位,trafficking,protein,particle,complex,subunit,NM,K31,表弟,基因位点,未检,正常对照,转录本,剪接,转录水平,正常人,无义变异,功能丧失,本家,致病性变异,蛋白质基因组学,密码子
AB值:
0.305657
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