目的:基于生物信息学筛选肺腺癌预后基因，探讨预后基因与免疫治疗反应性的关系，同时筛选其潜在药物。方法:在基因表达谱(GEO)数据库用GEO2R对GSE30219、GSE31210、GSE32863、GSE33532、GSE40791和GSE75037数据集进行差异表达分析，取 P<0.05且Log2(fold change)≥1的基因，用在线网站取交集得共同上调基因。在GSE31210、GSE42127、GSE68465、GSE72094数据集和癌症基因图谱计划(TCGA)数据库中获取生存资料，用R软件对上调基因行单因素COX回归分析，得到7个预后关键基因。通过基因表达谱交互分析(GEPIA2)网站验证基因表达与预后的关系。使用人类蛋白图集(HPA)在线工具验证关键基因的蛋白表达水平。京东基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)进行基因功能富集分析。使用仙桃学术分析关键基因与免疫治疗反应的相关性。最后通过CellMiner数据库筛选关键基因的敏感性药物。两组间的比较通过Student’s t检验评估。 结果:共获得142个共同上调基因，经单因素COX回归分析和GEPIA2网站验证得到7个预后关键基因，即细胞周期蛋白B2(CCNB2)、细胞分裂周期蛋白20(CDC20)、瓣状核酸内切酶1(FEN1)、鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)上皮细胞转化序列2(ECT2)、微小染色体维持蛋白4(MCM4)、母胚亮氨酸拉链激酶(MELK)和溶质载体家族2成员1(SLC2A1)。通过GO和KEGG功能富集分析，关键基因生物学功能主要富集在作用于DNA的催化活性方面，以及在细胞周期、人类T细胞白血病病毒1感染等信号通路上。此外，免疫相关性分析显示7个关键基因与肿瘤突变负荷(TMB)、表面抗原分化簇274(CD274)表达以及肿瘤免疫功能障碍和排斥评分(TIDE)明显相关。最后，7个关键基因得到37个对应的敏感性药物。结论:CCNB2、CDC20、FEN1、ECT2、MCM4、MELK和SLC2A1可以作为肺腺癌预后不良标志物，且可能与免疫治疗低反应性相关，同时得到37个对应的敏感性药物。

肺腺癌;预后;免疫治疗;生物信息学

赖凯;宋从宽;高明朗;耿庆

武汉大学人民医院胸外科　430060

中华实验外科杂志

[1]赖凯;宋从宽;高明朗;耿庆-.肺腺癌关键基因及潜在药物的生物信息学分析)[J].中华实验外科杂志,2022(06):1176-1179

GSE30219,GSE33532,GSE40791,GSE42127,GSE72094,母胚亮氨酸拉链激酶

肺腺癌,关键基因,潜在药物,生物信息学分析,预后基因,免疫治疗,治疗反应性,基因表达谱,GEO2R,GSE31210,GSE32863,GSE75037,差异表达分析,Log2,fold,change,线网,交集,同上,GSE68465,癌症基因图谱,TCGA,COX,交互分析,GEPIA2,图集,HPA,蛋白表达水平,京东,百科全书,基因本体论,基因功能,功能富集分析,仙桃,CellMiner,选关,性药物,Student,s ,检验评估,共获,细胞周期蛋白,CCNB2,细胞分裂,CDC20,核酸内切酶,FEN1,鸟嘌呤,GEF,上皮细胞,细胞转化,ECT2,MCM4,MELK,溶质载体,SLC2A1,生物学功能,催化活性,白血病,免疫相关,肿瘤突变负荷,TMB,表面抗原,分化簇,CD274,肿瘤免疫功能,TIDE,预后不良,低反应性

0.380486