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典型文献
基于GEO数据库芯片对反复种植失败者子宫内膜生物信息学分析
文献摘要:
目的:利用生物信息学分析方法挖掘反复胚胎种植失败患者相关关键基因及通路,探讨其对子宫内膜容受性的影响。方法:从GEO数据库中下载GSE26787数据集及GSE111974数据集为研究样本,以重复植入失败的患者及既往正常妊娠的女性的子宫内膜组织数据为研究对象,使用R语言将原始数据经过质量分析、归一化、探针和基因名转换,构建表达矩阵后,利用limma包进行差异基因的筛选,进而利用DAVID数据库进行GO及KEGG分析,再使用String数据库及Cytoscape软件筛选关键基因。结果:得到两数据集共同关键基因 PTGS2、 PLCB1、 MGP、 CYP3A5、 LPAR3、 VCAM1、 ALPL、 SLC1A1、 SLC4A7、 SULT1E1及关键通路hsa01100。 结论:本研究所得的关键基因及通路可通过调控子宫内膜氧化还原及代谢状态进而影响子宫内膜容受性,可作为研究其相关作用的靶点。
文献关键词:
胚胎移植;子宫内膜容受性;氧化还原;代谢途径
作者姓名:
欧宇阳;赵颖
作者机构:
广州中医药大学第一临床医学院,广州 510000;广州中医药大学第一附属医院,广州 510000
引用格式:
[1]欧宇阳;赵颖-.基于GEO数据库芯片对反复种植失败者子宫内膜生物信息学分析)[J].中华生殖与避孕杂志,2022(07):703-710
A类:
GSE26787,GSE111974,SLC1A1,SLC4A7,SULT1E1,hsa01100
B类:
GEO,反复种植失败,失败者,生物信息学分析,利用生物,反复胚胎种植失败,关键基因,对子,子宫内膜容受性,下载,集为,正常妊娠,子宫内膜组织,原始数据,质量分析,建表,limma,差异基因,DAVID,String,Cytoscape,选关,两数,PTGS2,PLCB1,MGP,CYP3A5,LPAR3,VCAM1,ALPL,路可通,氧化还原,代谢状态,胚胎移植,代谢途径
AB值:
0.317479
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