典型文献
基于生物信息学结合实验验证的常春藤皂苷元抗肝癌机制研究
文献摘要：
目的 应用生物信息学与实验相结合的方法,分析常春藤皂苷元(hederagenin,HD)抗肝癌的作用机制.方法 通过UCSC Xena数据库获取肝癌RNA-seq数据,应用R软件"Limma"包筛选肝癌差异基因,SwissTargetPrediction数据库预测HD作用靶点,取二者交集基因,String数据库构建交集基因的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,Cytoscape_3.9.0软件筛选PPI网络中核心基因,采用分子对接方法验证HD与核心基因的结合位点.采用MTT法观察HD对人肝癌HepG2细胞增殖的影响;采用Western blotting法检测HD对HepG2细胞和H22荷瘤小鼠模型瘤体内细胞分裂周期因子 25A(cell division cycle 25A,CDC25A)、CDC25B、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、雄性激素受体(androgen receptor,AR)、雌激素受体 1(estrogen receptor 1,ESR1)和前列腺素内过氧化物酶 2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)蛋白表达的影响.结果 生物信息学分析显示,HD可能作用于IL-6、CDC25A、PTGS2、AR、CDC25B和ESR1,从而发挥抗肝癌作用.HD显著抑制HepG2细胞增殖(P＜0.05、0.01),下调HepG2细胞和瘤体IL-6、CDC25A、ESR1和PTGS2蛋白表达水平(P＜0.01),上调AR蛋白表达水平(P＜0.01),下调瘤体CDC25B蛋白表达水平(P＜0.01).结论 HD能够通过调控IL-6、CDC25A、PTGS2、AR、CDC25B和ESR1,进而发挥抗肝癌的作用.
文献关键词：
常春藤皂苷元;肝癌;生物信息学;白细胞介素-6;细胞分裂周期因子25A;前列腺素内过氧化物酶2;雄性激素受体;细胞分裂周期因子25B;雌激素受体1
中图分类号：
作者姓名：
崔文超;刘明远;关宝生;曾佳;田亚妮;邓仲修;白雪
作者机构：
佳木斯大学基础医学院,黑龙江佳木斯 154007;佳木斯大学公共卫生学院,黑龙江佳木斯 154007
文献出处：
引用格式：
[1]崔文超;刘明远;关宝生;曾佳;田亚妮;邓仲修;白雪-.基于生物信息学结合实验验证的常春藤皂苷元抗肝癌机制研究)[J].中草药,2022(12):3704-3710
A类：
B类：
常春藤皂苷元,抗肝癌,hederagenin,HD,UCSC,Xena,seq,Limma,差异基因,SwissTargetPrediction,作用靶点,交集,String,数据库构建,建交,蛋白质相互作用,protein,interaction,PPI,Cytoscape,核心基因,分子对接,对接方法,方法验证,结合位点,MTT,HepG2,blotting,H22,荷瘤小鼠,小鼠模型,瘤体,细胞分裂,cell,division,cycle,CDC25A,CDC25B,interleukin,雄性激素受体,androgen,receptor,雌激素受体,estrogen,ESR1,前列腺素,prostaglandin,endoperoxide,synthase,PTGS2,生物信息学分析,蛋白表达水平
AB值：
0.275059
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