首站-论文投稿智能助手
典型文献
2019年冬季青岛市手足口病患者感染柯萨奇病毒A组16型基因特征分析
文献摘要:
目的 调查2019年冬季青岛市妇幼医院和中心医院手足口病(HFMD)住院患儿病原感染情况,分析柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)基因进化特征.方法 收集2019年冬季青岛地区HFMD住院患儿104份咽拭子,采用实时荧光定量PCR进行肠道病毒核酸检测.使用肠道病毒通用分型引物扩增阳性样本,扩增序列测序后进行Blast比对.设计Cox A16 VP1全长引物,通过半巢式PCR扩增测序,使用DNAStar进行核苷酸和氨基酸的基因分析,使用MEGA软件构建进化树.结果 HFMD住院患儿的咽拭子样本肠道病毒总体阳性率为57.7%(60/104).其中CoxA16阳性率为30.8%(32/104),Cox A6阳性率为26.9%(28/104).对32份Cox A16阳性的样本进行VP1区全长扩增、测序并进行比对和同源性分析,其核苷酸同源性为87.0%~100%,氨基酸同源性为98.3%~100%.系统进化分析表明,32株Cox A16中有17株为Cox A16 B1a基因型,另外15株为Cox A16 B1b基因型.结论 引起2019年冬季青岛地区住院HFMD的病原体之一是Cox A16,且同时流行Cox A16 的 B1a 和 B1b 型.
文献关键词:
手足口病;肠道病毒;柯萨奇病毒A组16型;基因特征
作者姓名:
姜法春;赵超;董鸿铭;贾静;王霞;王衍海;高晨;韩俊
作者机构:
青岛市疾病预防控制中心,山东青岛266033;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206;华北理工大学基础医学院,河北唐山063210;青岛市市北区疾病预防控制中心,山东青岛266022
文献出处:
引用格式:
[1]姜法春;赵超;董鸿铭;贾静;王霞;王衍海;高晨;韩俊-.2019年冬季青岛市手足口病患者感染柯萨奇病毒A组16型基因特征分析)[J].疾病监测,2022(06):755-759
A类:
B类:
青岛市,手足口病,柯萨奇病毒,基因特征分析,妇幼医院,中心医院,HFMD,住院患儿,病原感染,感染情况,基因进化,进化特征,青岛地区,咽拭子,肠道病毒,病毒核酸检测,引物,阳性样本,Blast,VP1,全长,过半,DNAStar,基因分析,MEGA,软件构建,进化树,子样本,体阳,CoxA16,A6,同源性分析,系统进化分析,B1a,基因型,B1b,病原体
AB值:
0.300541
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。