典型文献
基于线粒体COⅡ和ND4基因序列的塔里木裂腹鱼群体遗传多样性分析
文献摘要:
为探究塔里木裂腹鱼群体遗传多样性和遗传分化现状,实验选用车尔臣河、克孜勒河和阿克苏河3个不同地理种群的塔里木裂腹鱼共计126尾样本,进行线粒体DNA COⅡ和ND4基因序列的对比分析,探讨2种标记对塔里木裂腹鱼遗传多样性分析结果的差异和关系.结果显示,塔里木裂腹鱼线粒体DNA COⅡ和ND4基因序列的A+T含量均高于G+C含量,碱基组成具有偏倚性.基于线粒体DNA COⅡ和ND4基因序列分析,3个群体126个样本中分别确定了6个和23个单倍型,其中线粒体DNA COⅡ基因序列中存在共享单倍型现象,ND4基因序列中未发现共享单倍型.2种标记下群体的单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.738±0.019/0.904±0.014和0.02129±0.00298/0.04876±0.00149,呈现出高单倍型多态性和高核苷酸多态性的特征.2种标记的分子方差分析(AMOVA)均表明,在所有群体中遗传变异主要来源于群体间,且车尔臣河群体的塔里木裂腹鱼与其他2个群体的遗传分化均达到显著水平.贝叶斯法(BI)构建的BI树与单倍型网络图结构一致,塔里木裂腹鱼形成了2个分支.COⅡ和ND4基因序列的岐点分布图均呈现双峰型,表明塔里木裂腹鱼现在的分布是先前分化种群发生二次交流的结果.研究表明,塔里木裂腹鱼已分化出2个明显的地理种群,建议在进行种质资源保护以及开发利用时将车尔臣河群体作为一个单独的种群管理.
文献关键词:
塔里木裂腹鱼;遗传多样性;线粒体DNA;COⅡ;ND4
中图分类号:
作者姓名:
任永丽;代金彩;赵年桦;赵贺;魏杰;聂竹兰
作者机构:
塔里木大学动物科学与技术学院,新疆阿拉尔 843300
文献出处:
引用格式:
[1]任永丽;代金彩;赵年桦;赵贺;魏杰;聂竹兰-.基于线粒体COⅡ和ND4基因序列的塔里木裂腹鱼群体遗传多样性分析)[J].水产学报,2022(12):2274-2285
A类:
B类:
ND4,塔里木裂腹鱼,鱼群,群体遗传,遗传多样性分析,遗传分化,用车,车尔臣河,克孜勒河,阿克苏河,地理种群,鱼线,A+T,G+C,碱基组成,偏倚性,基因序列分析,中线,记下,单倍型多样性,核苷酸多样性,多态性,高核,子方,AMOVA,遗传变异,群体间,显著水平,贝叶斯法,BI,网络图,图结构,鱼形,分布图,双峰型,先前,群发,种质资源保护,种群管理
AB值:
0.248335
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