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禾谷缢管蚜气味降解酶鉴定及其与关键信息化学物质的分子对接
文献摘要：
为探究禾谷缢管蚜Rhopalosiphum padi气味降解酶(odorant degrading enzyme,ODE)与关键信息化学物质的作用模式,从其触角转录组中筛选属于ODE的细胞色素P450与谷胱甘肽-S-转移酶,利用IQ-tree 2.1.1软件构建进化树;根据FPKM值筛选出高表达蛋白,用SWISS-MODEL软件进行同源建模;并应用AutoDock软件与寄主植物挥发性气味和信息素进行分子对接.结果表明,筛选获得禾谷缢管蚜细胞色素P450基因30个,谷胱甘肽-S-转移酶基因10个,且40个基因均有完整的开放阅读框;根据FPKM值筛选出9个在禾谷缢管蚜触角表达量较高的基因,其中同源建模成功的有5个;同一蛋白与不同气味分子结合时,结合能有差异;结构相似的气味分子与不同蛋白结合时,结合位点与结合能相似.表明与气味结合蛋白相比较,禾谷缢管蚜ODE对气味分子的选择特异性较低.
文献关键词：
禾谷缢管蚜;转录组;气味降解酶;同源建模;分子对接
中图分类号：
作者姓名：
杨欢;郭冰;郝恩华;王菁桢;陆鹏飞;乔海莉
作者机构：
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,北京100083;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]杨欢;郭冰;郝恩华;王菁桢;陆鹏飞;乔海莉-.禾谷缢管蚜气味降解酶鉴定及其与关键信息化学物质的分子对接)[J].植物保护学报,2022(04):1119-1131
A类：
padi
B类：
禾谷缢管蚜,气味降解酶,关键信息,信息化学物质,分子对接,Rhopalosiphum,odorant,degrading,enzyme,作用模式,触角转录组,细胞色素,P450,谷胱甘肽,转移酶,IQ,tree,软件构建,进化树,FPKM,SWISS,MODEL,行同,同源建模,AutoDock,寄主植物,挥发性气味,信息素,酶基因,开放阅读框,同气,气味分子,分子结,结合能,结构相似,蛋白结合,结合位点,气味结合蛋白,白相
AB值：
0.379884
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