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典型文献
高粱BR信号转录因子BZR1基因家族的鉴定及激素应答分析
文献摘要:
为研究高粱转录因子BZR1基因家族的表达特征,以高粱BTx623为材料,通过生物信息学及实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)技术对高粱BZR1基因家族进行鉴定和激素应答分析.结果表明,在高粱基因组中共鉴定到9个BZR1基因家族成员,根据染色体位置命名为SbBZR1-1~SbBZR1-9,其氨基酸序列长度在191~716 aa之间,理论分子量大小在20.99~80.41 kD之间,理论等电点在4.75~10.62之间;系统进化树分析显示,高粱BZR1基因家族与单子叶水稻和玉米的同源性为67%~100%;该家族各个成员之间外显子和内含子的数量差异较大.SbBZR1-3、Sb-BZR1-4和SbBZR1-9基因在高粱不同器官中的表达具有组织特异性;经200 μmol/L脱落酸处理后,SbBZR1-3基因的相对表达量逐渐升高,在9h时达到最大,而高粱SbBZR1-4和SbBZR1-9基因的表达受到显著抑制;SbBZR1-3和SbBZR1-4基因在1 μmol/L油菜素内酯诱导下呈降低-升高-降低的表达趋势,但SbBZR1-9基因的表达受到显著抑制;在1 mmol/Lγ-氨基丁酸和100 μmol/L褪黑素处理下,SbBZR1-3、SbBZR1-4及SbBZR1-9基因均显著上调表达;经10 μmol/L吲哚乙酸处理后,Sb- BZR1-3基因呈先升高后降低的表达趋势,SbBZR1-9基因的表达受到显著抑制,SbBZR1-4基因呈升高-降低-升高-降低的表达趋势.表明高粱BZR1基因家族在激素应答过程中具有重要作用.
文献关键词:
高粱;BZR1基因家族;生物信息学分析;表达分析;鉴定
作者姓名:
杜巧丽;刘均霞;陈美晴;蒋君梅;任明见;李向阳;姜于兰;谢鑫
作者机构:
贵州大学农学院,农业微生物特色重点实验室,贵阳550025;桐梓县农业农村局,贵州遵义563200;贵州大学,绿色农药与农业生物工程教育部重点实验室,贵阳550025
文献出处:
引用格式:
[1]杜巧丽;刘均霞;陈美晴;蒋君梅;任明见;李向阳;姜于兰;谢鑫-.高粱BR信号转录因子BZR1基因家族的鉴定及激素应答分析)[J].植物保护学报,2022(03):848-856
A类:
BTx623,SbBZR1, BZR1
B类:
高粱,BR,基因家族,激素应答,应答分析,表达特征,quantitative,real,qPCR,氨基酸序列,aa,分子量,kD,等电点,系统进化树分析,单子叶,水稻,同源性,外显子,内含子,不同器官,有组织,组织特异性,脱落酸,酸处理,相对表达量,9h,油菜素内酯,氨基丁酸,褪黑素,素处理,吲哚乙酸,生物信息学分析,表达分析
AB值:
0.209866
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