典型文献
基于GEO和TCGA数据库筛选子宫内膜癌发病及预后的相关基因
文献摘要：
目的 通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发病及预后相关的基因.方法 下载基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出EC与正常子宫内膜组织细胞中的差异表达基因(DEGs).运用STRING在线数据库及DAVID在线数据库对DEGs进行蛋白-蛋白互作网络(PPI)分析、基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,并利用Cytoscape软件筛选出关键基因.通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的子宫内膜癌的生存资料对关键基因进行生存分析.结果 本研究共筛选出EC相关108个DEGs,其中10个关键基因为JUN、UBE2I、WT1、GATA2、WNT2、CXCL12、ZEB1、TCF4、FOXL2、PRKCA,均在 EC 中相对高表达.WNT2、TCF4和 FOXL2关键基因对患者的生存率差异有统计学意义(P＜0.05).Wnt信号通路可能对EC的发病有重要作用.结论WNT2、TCF4和FOXL2与EC的发病及预后有着密切关系,为EC新的诊断标志物和治疗靶点筛选提供新思路.
文献关键词：
子宫内膜癌;差异表达基因;关键基因;生物信息
中图分类号：
作者姓名：
邱雨欢;李留霞
作者机构：
郑州大学第一附属医院妇产科,河南郑州 450000
文献出处：
引用格式：
[1]邱雨欢;李留霞-.基于GEO和TCGA数据库筛选子宫内膜癌发病及预后的相关基因)[J].河南医学研究,2022(05):793-799
A类：
UBE2I
B类：
GEO,TCGA,子宫内膜癌,生物信息学方法,EC,下载,基因表达综合数据库,基因芯片,子宫内膜组织,组织细胞,差异表达基因,DEGs,STRING,DAVID,蛋白互作网络,PPI,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,代谢通路分析,Cytoscape,关键基因,癌症基因组图谱,生存分析,JUN,WT1,GATA2,WNT2,CXCL12,ZEB1,TCF4,FOXL2,PRKCA,Wnt,密切关系,诊断标志物,治疗靶点,靶点筛选
AB值：
0.317853
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
