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苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析
文献摘要：
利用RT-PCR技术从苦荞中克隆出2条漆酶(laccase)基因,运用生物信息学技术对2个基因序列进行分析,预测结构域、二级和三级蛋白结构,进行蛋白同源比对及进化树分析.结果表明,FtLAC-1基因序列开放阅读框为1695bp,编码564个氨基酸,FtLAC-2基因序列开放阅读框为1707bp,编码568个氨基酸.FtLAC-1和FtLAC-2蛋白预测分子量分别为61.41和62.47kDa,理论等电点分别为9.45和9.41,为亲水性蛋白,2个基因序列相似性较低,氨基酸序列同源性不高.qRT-PCR分析出其在苦荞不同组织器官存在差异性表达.结论为进一步探索FtLAC-1和FtLAC-2在苦荞薄果壳形成中的功能提供理论基础.
文献关键词：
苦荞;漆酶;基因克隆;生物信息学;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
杨晓琳;段迎;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花
作者机构：
山西中医药大学中药与食品工程学院,030619,山西太原;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,650221,云南昆明
文献出处：
引用格式：
[1]杨晓琳;段迎;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花-.苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析)[J].作物杂志,2022(03):73-79
A类：
FtLAC,1695bp,1707bp,47kDa
B类：
苦荞,漆酶,酶基因,生物信息学分析,laccase,生物信息学技术,基因序列,结构域,蛋白结构,同源比对,进化树分析,开放阅读框,分子量,等电点,亲水性,氨基酸序列,序列同源性,qRT,不同组织,组织器官,差异性表达,果壳,基因克隆,表达分析
AB值：
0.294619
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