典型文献
番茄4CL基因家族鉴定和氮素处理下的表达分析
文献摘要：
探究番茄4CL基因家族的基本理化性质、分子进化特性和其在不同浓度氮素下的表达模式.对番茄4CL基因家族成员进行全基因组鉴定,采用生物信息学方法对其进行分析,并在不同浓度氮素处理下进行qPCR验证.在番茄中共鉴定出6个4CL基因家族成员,全部成员均为稳定蛋白,有5个成员呈酸性,编码的氨基酸数在538-957之间,二级结构以无规则卷曲为主,三级结构除Sl4CL04以5bsw.1.A为模型,其他成员均以5bsr.1.A为模型.番茄4CL基因家族内含子数量在5-11之间,12个Motif在Sl4CL中排序及位置都非常保守,具有较高的同源性.启动子顺式作用元件分析发现MYB作用元件的分布最多,在不同浓度氮素处理下,6个基因表达量均有显著差异.对Sl4CL03构建过表达载体,亚细胞定位结果显示位于过氧化物酶体、叶绿体和细胞质.番茄4CL家族进化具有保守性和特异性,能够在氮素处理时进行相关机理调节.
文献关键词：
番茄;4CL基因家族;成员鉴定;氮素;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
马馨馨;许洋;赵欢欢;火兆燕;王树彬;钟凤林
作者机构：
福建农林大学园艺学院,福州 350002
文献出处：
引用格式：
[1]马馨馨;许洋;赵欢欢;火兆燕;王树彬;钟凤林-.番茄4CL基因家族鉴定和氮素处理下的表达分析)[J].生物技术通报,2022(04):163-173
A类：
Sl4CL04,5bsw,5bsr,Sl4CL,Sl4CL03
B类：
番茄,基因家族鉴定,氮素,素处理,表达分析,基本理化性质,分子进化,表达模式,全基因组鉴定,生物信息学方法,qPCR,呈酸性,二级结构,无规则,卷曲,三级结构,内含子,Motif,中排,同源性,启动子,顺式作用元件,MYB,基因表达量,过表达载体,亚细胞定位,定位结果,过氧化物酶体,叶绿体,细胞质,家族进化,保守性,成员鉴定
AB值：
0.303894
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