典型文献
滇西鼠疫疫源地野外鼠形动物斑点热群立克次体和莫氏立克次体感染调查
文献摘要:
目的:了解滇西鼠疫疫源地野外鼠形动物斑点热群立克次体(spotted fever group
Rickettsiae,SFGR)和莫氏立克次体(
Rickettsia mooseri,
R.mooseri)感染情况。
方法:应用磁珠法提取2015-2016年自滇西梁河县、剑川县和玉龙县鼠疫疫源地捕获的2 512只野外鼠形动物肝脏样本DNA,选用热休克蛋白groEL基因引物进行巢式PCR扩增。分别采用DNAStar 7.1软件和美国国家生物技术信息中心(NCBI)的GenBank进行基因序列剪切、拼接和Blast同源性比对分析,同时采用DNAStar 7.1软件和MEGA 6.0软件构建系统发育树。结果:感染SFGR的野外鼠形动物有锡金小鼠、斯氏家鼠、灰麝鼩和臭鼩鼱(各1只),总感染率为0.16%(4/2 512);未检出
R.mooseri感染。梁河县和剑川县鼠疫疫源地野外鼠形动物SFGR感染率分别为0.49%(3/611)和0.10%(1/1 029),玉龙县鼠疫疫源地野外鼠形动物未检出SFGR感染。同源性分析显示,SFGR阳性样本的基因序列与参考序列同源性为95.45%~100.00%;4份阳性样本间groEL基因部分序列高度相似,同源性达89.60%~97.40%。序列进化分析显示,梁河县鼠疫疫源地的3个SFGR阳性样本序列聚在同一分支,同源性达94.40%~97.40%;剑川县鼠疫疫源地的1个阳性样本序列单独为1个分支。
结论:滇西鼠疫疫源地野外鼠形动物SFGR感染率较低,未发现
R.mooseri感染。
文献关键词:
斑点热群立克次体;莫氏立克次体;鼠形动物;GroEL基因;鼠疫疫源地
中图分类号:
作者姓名:
贺琪楠;罗云燕;刘思彤;洪汝丹;艾志琼;朱俊洁;尹家祥
作者机构:
大理大学公共卫生学院,大理 671000;云南省曲靖市第二人民医院信息管理部,曲靖 655000
文献出处:
引用格式:
[1]贺琪楠;罗云燕;刘思彤;洪汝丹;艾志琼;朱俊洁;尹家祥-.滇西鼠疫疫源地野外鼠形动物斑点热群立克次体和莫氏立克次体感染调查)[J].中华地方病学杂志,2022(12):966-971
A类:
野外鼠形动物,Rickettsiae,SFGR,mooseri,groEL
B类:
滇西,鼠疫疫源地,斑点热群立克次体,莫氏立克次体,立克次体感染,感染调查,spotted,fever,group,感染情况,磁珠法,梁河县,剑川县,玉龙县,热休克蛋白,引物,DNAStar,生物技术,信息中心,NCBI,GenBank,基因序列,拼接,Blast,比对分析,MEGA,软件构建,建系,系统发育树,锡金小鼠,家鼠,臭鼩,鼩鼱,感染率,未检,同源性分析,阳性样本,参考序列,序列同源性,进化分析,GroEL
AB值:
0.198929
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