目的:基于全基因组测序数据，通过内源性激活期间菌株基因组突变分析，开展结核分枝杆菌（MTB）分子钟研究。方法:筛选MTB内源性激活全基因组研究文献，下载全基因组测序数据，提取初治-复发配对样本单核苷酸多态性（SNP）差异和菌株分离时间，运用Poisson回归模型拟合初治-复发时间间隔与差异SNP的关系，计算MTB分子钟，估算突变率。结果:若MTB传代时间为18 h，0~2年短期内源性激活突变率为6.47×10 -10（95% CI：5.59×10 -10~7.44×10 -10），明显高于2~14年长期内源性激活突变率（3.27×10 -10，95% CI：2.88×10 -10~3.69×10 -10）。0~、1~、2~、3~、5~、7~14年突变率分别为7.10×10 -10、6.06×10 -10、4.24×10 -10、5.34×10 -10、2.59×10 -10、1.26×10 -10。 结论:内源性激活复发期间，MTB突变率随初治-复发时间间隔增加而下降，本研究从微观层面验证了临床实践观察到的初治结核病2年内易复发现象。

结核病;分子钟;突变率;全基因组测序

陶必林;王钰婷;李忠奇;吴继周;王建明

南京医科大学公共卫生学院全球健康中心流行病学系，南京　211166;南京医科大学姑苏学院流行病学系，南京　211166

中华流行病学杂志

[1]陶必林;王钰婷;李忠奇;吴继周;王建明-.基于全基因组测序估算结核分枝杆菌分子钟)[J].中华流行病学杂志,2022(09):1462-1468

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