典型文献
系统发育研究在传染病分子流行病学中的应用
文献摘要：
测序技术的快速发展导致病原体基因数据急剧增加，将这些数据与系统发育分析方法相结合，可用于阐述病原体的起源和进化、流行过程中的时空分布、参数变化以及抗原、毒力、耐药性等表型特征变化规律、病原体传播趋势预测等。本文简述了系统发育研究的目的和系统发育树的构建方法，阐述了距离法、最大简约法、最大似然法、贝叶斯法等常用系统发育重建方法的优缺点和适用范围，并重点回顾了系统动力学和系统地理学方法在国内外研究中的应用及主要流行病学参数的估计方法，通过综述也发现，病毒基因组数据建立的带有时间和地点注释的系统发育树越来越多地用于传染病疫情暴发调查和常规监测。
文献关键词：
传染病;分子流行病学;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
王璐琦;熊海燕;王伟炳
作者机构：
复旦大学公共卫生学院流行病教研室，上海 200032
文献出处：
引用格式：
[1]王璐琦;熊海燕;王伟炳-.系统发育研究在传染病分子流行病学中的应用)[J].中华流行病学杂志,2022(02):282-285
A类：
B类：
分子流行病学,基因数据,系统发育分析,参数变化,毒力,耐药性,表型特征,特征变化,病原体传播,传播趋势,趋势预测,系统发育树,构建方法,简约,约法,最大似然法,贝叶斯法,重建方法,系统动力学,地理学,估计方法,病毒基因组,基因组数据,传染病疫情,疫情暴发,暴发调查,常规监测
AB值：
0.333019
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