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典型文献
鹅源星状病毒TaqMan探针和SYBR Green Ⅰ染料法荧光定量PCR检测方法的建立及其应用比较
文献摘要:
鹅源星状病毒(goose astrovirus,GoAstV)是国内新发雏鹅痛风病病原,为更好地应用于临床检测,本试验针对GoAstV分别建立了基于TaqMan探针和SYBR Green Ⅰ染料的2种实时荧光定量PCR方法,并比较两者的优劣.首先根据GoAstV的ORF1b基因保守序列设计特异性引物和探针,通过优化反应条件和反应体系,分别建立Taq-Man和SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR方法,并对其进行特异性、敏感性、重复性测定和临床样品检验.结果显示,2种方法均能特异性检测GoAstV,Ct值在质粒标准品浓度2.5×102~2.5×108 copies/λL范围内线性关系良好,相关系数均为0.999;探针法和染料法的最低检测限分别为2.5×101,2.5×102 copies/μL;2种方法重复性试验组内与组间变异系数均小于2.50%.对近1年收集的71份临床疑似样本进行检测,探针法和染料法的阳性检出率分别为49.30%和42.25%,探针法的检出率较高.结果表明,本试验建立的TaqMan探针和SYBR Green Ⅰ染料荧光定量PCR方法均具有特异性强、敏感性高、重复性好优点,可应用于临床GoAstV的检测,其中尤以TaqMan探针法的灵敏度较高.
文献关键词:
鹅源星状病毒;荧光定量PCR;TaqMan探针;SYBR Green Ⅰ染料
作者姓名:
邓昕竹;余群;朱盈名;赵自亮;陆婧;赵光伟;张立武;程方俊;杨晓伟
作者机构:
西南大学动物医学学院,重庆荣昌402460;重庆三杰众鑫生物工程有限公司,重庆荣昌402460
文献出处:
引用格式:
[1]邓昕竹;余群;朱盈名;赵自亮;陆婧;赵光伟;张立武;程方俊;杨晓伟-.鹅源星状病毒TaqMan探针和SYBR Green Ⅰ染料法荧光定量PCR检测方法的建立及其应用比较)[J].中国兽医学报,2022(10):1970-1976
A类:
鹅源星状病毒,GoAstV
B类:
TaqMan,SYBR,Green,染料法,应用比较,goose,astrovirus,雏鹅痛风,痛风病,临床检测,ORF1b,保守序列,序列设计,特异性引物,优化反应,反应条件,反应体系,品检,特异性检测,Ct,质粒,标准品,copies,内线,探针法,检测限,重复性试验,组间变异,阳性检出率,尤以
AB值:
0.261468
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