典型文献
1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析
文献摘要：
为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地不动杆菌(LYS68A).采用微量肉汤稀释法测定菌株对8种抗菌药物的敏感性,并通过全基因组测序和比较基因组学分析该菌株的耐药特征.药敏试验及PCR检测发现,尽管该菌株对多西环素和替加环素高度敏感,但却携带对替加环素耐药的tet(X3)基因.进一步全基因组测序发现菌株LYS68A未携带耐药质粒,其染色体上共携带tet(X3)、tet(X6)、floR、sul1、aadA2、dfrA12、aph(3')-I、mphE 和 sul2 等 9 个耐药基因,构成了一个29 252 bp的多重耐药区并以一个整体插入到基因组tRNA-Gly的上游.耐药基因tet(X6)的基因环境(hp-tet(X6)-α/β hydrolase-GMP synthase)与2020年在1株奇异变形杆菌中发现的tet(X6)的基因环境同源性高达99％,推测其是通过ISVsa3和假定蛋白(hp)之间的热点区域(TCTTCC)经同源重组获得.耐药基因tet(X3)的基因环境与质粒p34AB(MK134375)中 tet(X3)的上、下游序列高度相似,主要区别是前者仅一侧含有ISVsa3,而另一侧的插入序列在同源重组后缺失,结果导致 tet(X3)失去独立在菌属间水平传播能力.本试验首次在1株替加环素敏感的禽源印地不动杆菌菌株LYS68A的染色体上同时检出tet(X6)和tet(X3)基因,且两种tet(X)的变异体主要通过菌属间的同源重组获得.
文献关键词：
印地不动杆菌;比较基因组学;tet(X6);tet(X3)
中图分类号：
作者姓名：
李垠树;赵冰;孙华润;何坤;许慧;梁玉蕾;胡功政;苑丽
作者机构：
河南农业大学 动物医学院,河南郑州 450046
文献出处：
引用格式：
[1]李垠树;赵冰;孙华润;何坤;许慧;梁玉蕾;胡功政;苑丽-.1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析)[J].中国兽医学报,2022(08):1620-1625
A类：
印地不动杆菌,禽类散养场,LYS68A,mphE,ISVsa3,TCTTCC,p34AB,MK134375
B类：
tet,X6,X3,比较基因组学分析,动物园,分离菌,替加环素,耐药机制,某市,珍珠鸡,鸡粪,粪便样品,细菌分离,分离纯化,革兰染色,细菌鉴定,序列比对,微量肉汤稀释法,抗菌药物,全基因组测序,耐药特征,药敏试验,多西环素,耐药质粒,floR,sul1,aadA2,dfrA12,aph,sul2,耐药基因,bp,多重耐药,一个整,tRNA,Gly,hp,hydrolase,GMP,synthase,奇异变形杆菌,同源性,假定,热点区域,同源重组,要区,另一侧,插入序列,属间,水平传播,传播能力,变异体
AB值：
0.257807
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