典型文献
基于宏病毒组测序技术的苹果病毒病鉴定与分析
文献摘要：
采用宏病毒组测序技术(Virome Sequencing Technology)对河南地区染病苹果树进行病毒检测与分析,从建库测序的苹果叶片中共检测出13种病毒,其中有5种苹果病毒:苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus,ASGV)、苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)、苹果褪绿叶斑病毒(apple chlorotic leaf spot virus,ACLSV)、苹果坏死花叶病毒(apple necrotic mosaic virus,ApNMV)和苹果绿皱缩相关病毒(apple green crinkle associated virus,AGCaV).对病毒检测结果中的5种苹果病毒进行RT-PCR验证,扩增后均获得目的条带,与宏病毒组测序检测结果一致,表明宏病毒组测序检测结果精准可靠.根据测序结果设计特异性引物对ASPV全长进行扩增,得到1条长度为9 246 nt的ASPV-HN分离物基因组,与NCBI数据库中已报道的19个ASPV分离物的基因组核苷酸序列一致性为75.48％～79.85％;宏病毒组测序拼接所得的两条长度均为6 475 nt的ASGV基因组全长基因ASGV-HN1和ASGV-HN2,与NCBI数据库中已报道的18个ASGV分离物的基因组核苷酸序列一致性为79.98％～98.08％.对53份河南不同产区的苹果叶片样品进行苹果花叶病毒(apple mosaic virus,ApMV)和ApNMV的检测,结果显示花叶病症样品中均检测出ApNMV,未检测到ApMV,表明ApNMV可能是引起河南地区苹果花叶病的主要病原.
文献关键词：
苹果;病毒病;宏病毒组测序技术;RT-PCR;检测;苹果花叶病
中图分类号：
作者姓名：
夏炎;黄松;武雪莉;刘一琪;王苗苗;宋春晖;白团辉;宋尚伟;庞宏光;焦健;郑先波
作者机构：
河南农业大学园艺学院,郑州450002;信阳农林学院,河南信阳464001
文献出处：
引用格式：
[1]夏炎;黄松;武雪莉;刘一琪;王苗苗;宋春晖;白团辉;宋尚伟;庞宏光;焦健;郑先波-.基于宏病毒组测序技术的苹果病毒病鉴定与分析)[J].园艺学报,2022(07):1415-1428
A类：
宏病毒组测序技术,Virome,苹果茎沟病毒,苹果茎痘病毒,ApNMV,AGCaV,HN1,HN2,ApMV
B类：
苹果病毒病,Sequencing,Technology,河南地区,苹果树,病毒检测,检测与分析,建库,苹果叶片,apple,stem,grooving,virus,ASGV,pitting,ASPV,绿叶,叶斑病,chlorotic,leaf,spot,ACLSV,花叶病毒,necrotic,mosaic,苹果绿,皱缩,green,crinkle,associated,条带,特异性引物,长进,nt,分离物,NCBI,序列一致性,拼接,基因组全长,不同产区,苹果花叶病,病症,未检,主要病原
AB值：
0.22965
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
