典型文献
月季TIFY基因家族的全基因组分析
文献摘要：
[目的]研究TIFY基因家族在月季(Rosa chinensis Jacq.)干旱胁迫与盐胁迫发生过程中的作用.[方法]利用生物信息学方法对月季TIFY家族成员进行全基因组鉴定、系统进化树分析、理化性质分析、染色体定位分析、基因共线性分析和基因结构分析,并结合转录组表达数据以及顺式元件分析筛选与盐胁迫、干旱胁迫响应相关的基因.[结果]鉴定了13个月季TIFY家族成员;通过与拟南芥、水稻共同构建的进化树,将这些成员分为4个亚家族;这些成员分布在5条染色体上,与拟南芥同源性更高;各亚家族特征结构域完整.其中6个RcTIFY成员在干旱胁迫和盐胁迫中发挥着积极作用;顺式元件结果表明,大多数RcTIFY成员可能参与了脱落酸与茉莉酸甲酯的响应.积极响应干旱胁迫或盐胁迫的TIFY家族成员RcTIFY5a、RcTIFY5b、RcTIFY6a、RcTIFY6b、RcTI-FY10b均含有丰富的脱落酸、茉莉酸甲酯响应元件.[结论]月季中有13个RcTIFY基因,多个成员在干旱胁迫和盐胁迫响应中发挥着积极作用,脱落酸和茉莉酸甲酯是该家族成员的潜在调控激素.
文献关键词：
TIFY基因家族;生物信息学;干旱胁迫;盐胁迫;脱落酸;茉莉酸甲酯
中图分类号：
作者姓名：
王昊宁;周佩;刘燕;刘梦;朱晓仪;石力匀;栗燕;逯久幸
作者机构：
河南农业大学风景园林与艺术学院,河南郑州 450002;河南省优质花卉蔬菜种苗工程技术中心,河南郑州 450002
文献出处：
引用格式：
[1]王昊宁;周佩;刘燕;刘梦;朱晓仪;石力匀;栗燕;逯久幸-.月季TIFY基因家族的全基因组分析)[J].河南农业大学学报,2022(06):990-997,1060
A类：
RcTIFY,RcTIFY5a,RcTIFY5b,RcTIFY6a,RcTIFY6b,RcTI,FY10b
B类：
月季,基因家族,全基因组分析,Rosa,chinensis,Jacq,盐胁迫,利用生物,生物信息学方法,全基因组鉴定,系统进化树分析,性质分析,染色体定位,定位分析,共线性分析,基因结构,转录组,顺式,干旱胁迫响应,拟南芥,水稻,亚家族,同源性,特征结构,结构域,脱落酸,茉莉酸甲酯,积极响应,响应元
AB值：
0.197674
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