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白花泡桐NCED基因家族分析及其对丛枝植原体的响应
文献摘要：
[目的]研究NCED家族基因在泡桐丛枝病发生过程中的作用.[方法]基于白花泡桐(Paulownia fortune)基因组图谱,采用生物信息学方法对白花泡桐NCED(PfNCED)家族进行成员鉴定,系统进化、基因结构和启动子顺式作用元件进行分析,并结合转录组、实时定量PCR和互作蛋白预测等方法筛选与丛枝病发生相关基因.[结果]发现PfNCED家族共有28个基因,分布在8条染色体上;进化树分析结果表明该家族基因可以分为4组,与拟南芥的同源性较高;共线性分析发现该家族发生5次片段复制事件;顺式作用元件表明PfNCED可能响应植物激素处理和环境胁迫.结合丛枝病发生前后的转录组分析,发现7个差异PfNCED可能与泡桐丛枝病发生相关;进一步的蛋白互作网络分析发现PfNCED16可能在丛枝病腋芽形成中发挥重要作用.[结论]白花泡桐中有28个PfNCED基因,其中PfNCED16可能在白花泡桐丛枝形成过程中发挥重要作用.
文献关键词：
泡桐丛枝病;9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED);基因表达;进化分析;蛋白互作
中图分类号：
作者姓名：
徐赛赛;曹亚兵;曹喜兵;董洋;翟晓巧;范国强
作者机构：
河南农业大学林学院,河南郑州 450002;河南省林业科学研究院,河南郑州 450008
文献出处：
引用格式：
[1]徐赛赛;曹亚兵;曹喜兵;董洋;翟晓巧;范国强-.白花泡桐NCED基因家族分析及其对丛枝植原体的响应)[J].河南农业大学学报,2022(06):968-978,1032
A类：
泡桐丛枝病,Paulownia,PfNCED,PfNCED16
B类：
白花泡桐,基因家族分析,丛枝植原体,家族基因,fortune,基因组图谱,生物信息学方法,成员鉴定,系统进化,基因结构,启动子,顺式作用元件,实时定量,互作蛋白,进化树分析,拟南芥,同源性,共线性分析,植物激素,激素处理,环境胁迫,发生前后,转录组分析,蛋白互作网络分析,腋芽,类胡萝卜素,加氧酶,进化分析
AB值：
0.219161
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