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典型文献
糖尿病性心肌病小鼠心肌组织差异表达环状RNA的探讨
文献摘要:
目的:鉴定糖尿病性心肌病(DCM)小鼠心肌组织差异表达的环状RNA(circRNA),并分析其可能的生物学功能及调控网络。方法:C57BL/6小鼠,雄性,8周龄,体重21~27 g。选取8只小鼠作为正常组,15只进行建模。通过腹腔注射链脲佐菌素建立糖尿病小鼠模型。注射1周后,测定小鼠空腹血糖水平,经检测12只小鼠建模成功。在相同的实验室条件下饲养小鼠12周,通过超声心动图检测小鼠的心脏结构和功能,筛选出左心室射血分数≤60%,且二尖瓣舒张早期最大血流速度与心房收缩期最大血流速度比值(E/A)≤1.6的糖尿病小鼠作为DCM组( n=3)。于DCM组确立当天麻醉后处死正常组和DCM组小鼠,取出心脏,从心肌组织中提取RNA备用。采用高通量测序对DCM组和正常组小鼠心肌组织中的RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行差异性分析,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)在组织水平上对分析结果进行验证,并对鉴定的差异circRNA进行GO分析和KEGG通路分析。通过微小RNA(miRNA)靶基因预测软件进行差异表达circRNA-miRNA相互作用预测。 结果:DCM小鼠心肌组织中共鉴定出63种差异表达circRNA。RT-qPCR验证结果示同源性分析筛选出的16种差异表达circRNA中8种组织水平的表达与测序结果一致,其中7种表达上调、1种表达下调。KEGG通路分析结果示,上调的circRNA主要与腺苷酸活化蛋白激酶(AMPK)信号通路以及细胞间的黏着连接通路有关,下调的circRNA主要与心肌病有关。GO功能分析显示,上调表达的circRNA在分子功能方面主要与离子、蛋白质、激酶等因子的结合过程有关,并且在细胞组分方面参与调节细胞内结构尤其是细胞器的构成。分子功能与细胞组分方面的功能分析显示,上调的circRNA与细胞组分起源、募集、组织的生物学过程相关,并由此参与细胞生物学过程的调控;下调的circRNA在分子功能方面与催化活性相关,也与蛋白激酶的结合过程、转移酶及钙调蛋白的活性有关,在细胞组分方面与收缩性纤维的组分、肌原纤维的构成密切相关,而在富集的生物学过程GO分析术语中,包括赖氨酸肽基修饰、肌节的构成、肌原纤维的装配、心肌组织的形态学发育、心肌肥厚等生物学过程。本研究鉴定的差异表达circRNA均存在miRNA的结合位点,且部分miRNA与保护心肌细胞正常生理功能、抗氧化应激损伤、抑制心肌细胞凋亡以及抗心肌肥厚有关。结论:DCM小鼠心肌组织中circRNA存在差异表达,且其与DCM的发生发展密切相关。
文献关键词:
糖尿病;心肌疾病;心肌组织;环状RNA
作者姓名:
吴晓光;张淑晨;周祥
作者机构:
苏州大学附属第二医院心血管科,苏州 215000
引用格式:
[1]吴晓光;张淑晨;周祥-.糖尿病性心肌病小鼠心肌组织差异表达环状RNA的探讨)[J].中华心血管病杂志,2022(05):501-508
A类:
DeSeq2
B类:
糖尿病性心肌病,心肌组织,组织差异表达,DCM,circRNA,生物学功能,调控网络,C57BL,周龄,腹腔注射,链脲佐菌素,糖尿病小鼠模型,空腹血糖,血糖水平,经检测,饲养,超声心动图,心脏结构,结构和功能,左心室射血分数,二尖瓣,最大血流速度,心房,收缩期,速度比,当天,天麻,处死,备用,鉴定分析,差异性分析,qPCR,通路分析,miRNA,靶基因预测,预测软件,种差,同源性分析,腺苷酸活化蛋白激酶,AMPK,黏着,接通,功能分析,细胞器,分起,募集,生物学过程,细胞生物学,催化活性,活性相,转移酶,钙调蛋白,收缩性,肌原纤维,赖氨酸,肽基,肌节,心肌肥厚,结合位点,生理功能,抗氧化应激,氧化应激损伤,心肌细胞凋亡,心肌疾病
AB值:
0.254075
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