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毛竹基因组中热激蛋白HSP90基因家族的鉴定与分析
文献摘要：
为深入了解毛竹中的热激蛋白(heat shock protein,HSP)及其特性,借助生物信息学工具对毛竹HSP90家族基因进行鉴定,分析其理化性质、结构特征、系统进化关系以及组织特异性表达模式.结果表明,毛竹基因组中含11个HSP90家族基因,分布于9条scaffold上,外显子5～20个不等;系统进化关系分析显示毛竹11个HSP90家族基因分属于3组,结构特征相似的成员分属于同一组;共线性分析表明毛竹中仅有1个HSP90基因(PH02Gene09089)与水稻的HSP90基因不存在共线性关系;亚细胞定位结果显示毛竹HSP90蛋白定位于细胞质或内质网中;HSP90家族成员启动子上分布有丰富的与激素、光照、及逆境相关的顺式作用元件;已发表的转录组数据及RT-PCR结果表明,HSP90家族各基因在不同组织中的表达模式不同.本研究结果加深了对毛竹HSP90基因家族的了解,可为研究该家族基因的生物学功能及后续利用提供参考.
文献关键词：
毛竹;HSP90家族基因;组织特异性;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
陈思睿
作者机构：
St.Aidan's Anglican Girls'School,Brisbane,Queensland 4075
文献出处：
引用格式：
[1]陈思睿-.毛竹基因组中热激蛋白HSP90基因家族的鉴定与分析)[J].福建林业科技,2022(01):7-14
A类：
PH02Gene09089
B类：
毛竹,热激蛋白,HSP90,基因家族,heat,shock,protein,生物信息学工具,家族基因,系统进化,进化关系,组织特异性,特异性表达,表达模式,scaffold,外显子,关系分析,分属,共线性分析,水稻,亚细胞定位,定位结果,蛋白定位,细胞质,内质网,启动子,逆境,顺式作用元件,转录组数据,不同组织,生物学功能,后续利用,表达分析
AB值：
0.297209
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