典型文献
基于网络药理学和分子对接探讨冬虫夏草抗肿瘤的作用机制
文献摘要:
目的 基于网络药理学方法和分子对接技术探究冬虫夏草抗肿瘤的作用机制.方法 利用TCMSP、CNKI、PubMed、Drugbank、Stitch和Swiss target prediction等平台检索冬虫夏草的化学成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库筛选肿瘤相关基因,运用Cytoscape 3.7.2构建冬虫夏草活性成分–靶点网络,通过String数据库对关键靶点构建网络互作(PPI)网络,并进行基因本体(GO)基因和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证.结果 共得到冬虫夏草22个化合物,86个抗肿瘤共同靶点,主要包括环加氧酶(PTGS)2、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、胱天蛋白酶3(CASP3)、JUN基因等关键靶点.GO分析与KEGG通路结果显示,冬虫夏草抗肿瘤涉及到多种生物学过程以及PPAR、花生四烯代谢、5-羟色胺信号通路等多种信号通路.将关键化合物和靶点进行分子对接,提示冬虫夏草抗肿瘤可能的前5个主要活性成分11,14-二十碳二烯酸、花生四烯酸、黄豆黄素、胆甾醇和豆甾醇与关键靶点PTGS2、PTGS1、PGR、HMGCR和CNR1均能自发结合.结论 初步探讨了冬虫夏草抗肿瘤的主要活性成分、相关靶点及相关通路,发现冬虫夏草可以通过多成分、多靶点、多通路抗肿瘤,为后期实验验证提供了参考依据.
文献关键词:
冬虫夏草;抗肿瘤;网络药理学;分子对接;信号通路
中图分类号:
作者姓名:
刘鑫;范卫锋;戴卫波;胡显镜;梅全喜;彭伟文
作者机构:
广州中医药大学附属中山中医院,广东 中山 528400;深圳市宝安纯中医治疗医院,广东 深圳 518101
文献出处:
引用格式:
[1]刘鑫;范卫锋;戴卫波;胡显镜;梅全喜;彭伟文-.基于网络药理学和分子对接探讨冬虫夏草抗肿瘤的作用机制)[J].现代药物与临床,2022(03):483-492
A类:
黄豆黄素
B类:
网络药理学,冬虫夏草,分子对接技术,技术探究,TCMSP,Drugbank,Stitch,Swiss,target,prediction,作用靶点,GeneCards,OMIM,肿瘤相关,Cytoscape,靶点网络,String,关键靶点,建网,PPI,基因本体,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,AutoDock,Vina,Pymol,对药,个化,环加氧酶,丝裂原活化蛋白激酶,MAPK3,过氧化物酶体,激活受体,PPARG,胱天蛋白酶,CASP3,JUN,生物学过程,羟色胺,主要活性成分,花生四烯酸,胆甾醇,醇和,豆甾醇,PTGS2,PTGS1,PGR,HMGCR,CNR1,发结,相关通路,多成分,多靶点,多通路
AB值:
0.3602
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