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影响骨髓间充质干细胞分化为雪旺氏细胞的转录组测序分析
文献摘要：
目的 通过转录组测序筛选影响大鼠骨髓间充质干细胞分化为雪旺氏细胞的相关差异基因.方法 分离培养大鼠骨髓间充质干细胞,将所有细胞分为两组,实验组细胞体外诱导为雪旺氏细胞,对照组细胞常规培养;实验组细胞诱导完成免疫荧光鉴定S-100B与胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达;取两组细胞进行转录组测序,筛选出差异表达的基因,然后对其进行差异基因功能和通路显著富集性分析.结果 实验组细胞诱导后GFAP及S-100B表达阳性.转录组测序结果显示,实验组与对照组细胞相比,共有3 715个基因差异表达,其中表达上调基因1 540个,表达下调基因2 175个.基因本体(GO)分析发现差异基因富集在:①生物学进程:Wnt信号通路的负调控参与成骨细胞分化(P=0.000)、运动神经元迁移(P=0.000)、负调控轴突延伸参与再生(P=0.000)、跨膜受体蛋白酪氨酸磷酸酶信号通路(P=0.000)、损伤轴突生长锥形成的负调控(P=0.000)、损伤轴突侧枝萌发的正向调节(P=0.000)、神经系统发育的调节(P=0.000);②细胞成分:雪旺氏细胞微绒毛(P=0.000)、神经网(P=0.017);③分子功能S100蛋白结合(P=0.003)、神经纤毛蛋白结合(P=0.003).KEGG Pathway分析结果发现,主要涉及细胞外基质受体相互作用通路(P=0.000)、磷肌酰肌醇-3-激酶/丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶(PI3K-Akt)信号通路(P=0.000)、轴突导向(P=0.000)、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路(P=0.000)、Wnt信号通路(P=0.000)、Ras信号通路(P=0.003)、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号通路(P=0.005).结论 骨髓间充质干细胞诱导为雪旺氏细胞过程可能主要与调节PI3K-Akt、Wnt、MAPK等信号通路及轴突形成有关.
文献关键词：
骨髓间充质干细胞;体外分化;雪旺氏细胞;转录组测序;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
甘泉;周子荐;王东
作者机构：
中山大学附属第七医院骨科,广东深圳518107
文献出处：
引用格式：
[1]甘泉;周子荐;王东-.影响骨髓间充质干细胞分化为雪旺氏细胞的转录组测序分析)[J].热带医学杂志,2022(04):464-468,封4
A类：
B类：
骨髓间充质干细胞,雪旺氏细胞,转录组测序分析,差异基因,分离培养,养大,细胞体,体外诱导,规培,细胞诱导,免疫荧光,100B,胶质纤维酸性蛋白,GFAP,出差,基因功能,表达阳性,基因差异表达,基因本体,基因富集,Wnt,负调控,成骨细胞分化,运动神经元,神经元迁移,调控轴,轴突延伸,膜受体,受体蛋白,蛋白酪氨酸磷酸酶,轴突生长,生长锥,锥形,侧枝,萌发,神经系统发育,细胞成分,微绒毛,S100,蛋白结合,纤毛,毛蛋,Pathway,细胞外基质,作用通路,肌醇,丝氨酸,苏氨酸蛋白激酶,PI3K,Akt,轴突导向,缺氧诱导因子,HIF,Ras,丝裂原激活蛋白激酶,MAPK,体外分化
AB值：
0.331671
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