典型文献
基于转录组学探讨蚕梅方抗结直肠癌的作用机制
文献摘要：
目的 利用二代测序技术探讨蚕梅方在转录组学层面上抗结直肠癌活性的作用机制.方法 将来源于《本草纲目》中治疗肠风的核心药物乌梅及僵蚕组方为蚕梅方,对RKO细胞(肠癌细胞)进行干扰,采用二代高通量测序平台(Illumina Hi-Seq)测序技术分别对对照组(RKO-control)和实验组(RKO-treatment)进行高通量转录组测序,并应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行生物功能富集分析,通过分子对接方法验证活性成分与关键靶点的结合作用.结果 差异基因数为2516个,其中上调基因1279个,下调基因1237个,筛选得到叉头框蛋白D1(FOXD1)、腓骨蛋白2(FBLN2)、低密度脂蛋白受体A类结构域2(LDLRAD2)三个与结直肠癌相关的核心差异基因.GO分析发现,差异基因主要涉及单体代谢过程、细胞周期过程以及对有机物质的调控等过程;KEGG分析发现,差异表达基因主要涉及代谢途径、细胞周期和RNA转运等信号通路,分子对接验证了蚕梅方主要活性化合物与核心靶点有较高的结合活性.结论 蚕梅方可能通过多靶点、多途径的作用方式,从基因的转录表达、细胞代谢和凋亡等方面发挥抗结直肠癌作用.
文献关键词：
蚕梅方;结直肠癌;转录组学;代谢通路;高通量测序平台;中药研究
中图分类号：
作者姓名：
郭翠;徐祎敏;韩馨悦;刘晓强;解润南;孟祥雪;付晓伶
作者机构：
辽宁中医药大学研究生院 辽宁沈阳 110847;上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院肿瘤二科 上海200437;上海市静安区市北医院疼痛科 上海200435;上海市宝山区庙行镇社区卫生服务中心 上海200443
文献出处：
引用格式：
[1]郭翠;徐祎敏;韩馨悦;刘晓强;解润南;孟祥雪;付晓伶-.基于转录组学探讨蚕梅方抗结直肠癌的作用机制)[J].上海中医药杂志,2022(02):54-60
A类：
蚕梅方,LDLRAD2
B类：
转录组学,抗结直肠癌,二代测序技术,技术探讨,本草纲目,肠风,核心药物,乌梅,僵蚕,组方,方为,RKO,癌细胞,二代高通量测序,高通量测序平台,Illumina,Hi,Seq,对对,control,treatment,高通量转录组测序,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,生物功能,功能富集分析,分子对接,对接方法,方法验证,活性成分,关键靶点,差异基因,选得,叉头框蛋白,FOXD1,腓骨,骨蛋白,FBLN2,低密度脂蛋白受体,结构域,代谢过程,细胞周期,差异表达基因,代谢途径,活性化合物,核心靶点,结合活性,多靶点,多途径,作用方式,转录表达,细胞代谢,代谢通路,中药研究
AB值：
0.332687
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