目的 对2011年和2017年分别在我国甘肃省和海南省分离的两株盖塔病毒(GS11-155和HNDZ1712-1)进行全基因组核苷酸序列测定,分析其与我国1964年首次分离的盖塔病毒(M1)的分子差异及分子遗传进化特征.方法 使用病毒基因扩增技术测定新分离的两株盖塔病毒全基因组核苷酸序列,建立盖塔病毒基因组数据集并使用生物信息学软件进行病毒分子特征及分子遗传进化分析等.结果 两株新分离盖塔病毒(GS11-155和HN-DZ1712-1)基因组全长分别为11 690nt和11621nt.两株病毒均具有甲病毒基因组结构特征.虽然两株病毒的结构基因、非结构基因以及非编码的连接区核苷酸序列长度均完全相同,但是病毒基因组5′和3′非编码区的核苷酸序列长度存在差异.两病毒株基因组3′UTR重复序列单元的结构未发生变化.病毒基因组同源性分析结果显示,海南省2017年分离的盖塔病毒(HNDZ1712-1)与我国于1964年首次在海南省蚊虫分离的盖塔病毒(M1)之间的核苷酸与氨基酸同源性分别为97.7％和98.1％.盖塔病毒全基因组核苷酸序列的分子遗传进化分析结果显示,本研究的两株病毒及其所属病毒株分别形成两个单独的进化簇,甘肃2011年进化簇和海南2017年进化簇,并与1964年海南首次分离的病毒形成完全独立的进化种群.结论 虽然HNDZ1712-1病毒同样分离自海南岛蚊虫标本,但是与1964年海南岛分离的病毒(M1)处在完全不同的进化分支,而与数千公里之外的甘肃省分离株(GS11-155)具有较近的进化关系,提示新分离的两株盖塔病毒与1964年分离的盖塔病毒存在较大分子遗传差异.

盖塔病毒;分子遗传进化;人畜共患病

李彬;付士红;查冰;范娜;李元元;徐学平;应思超;聂凯;许松涛;李兴洲;王环宇;梁国栋

佳木斯大学公共卫生学院,黑龙江佳木斯154007;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京100052;中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,上海200025

中国热带医学

[1]李彬;付士红;查冰;范娜;李元元;徐学平;应思超;聂凯;许松涛;李兴洲;王环宇;梁国栋-.两株盖塔病毒全基因组序列测定与分子遗传进化)[J].中国热带医学,2022(10):916-922

GS11,HNDZ1712,DZ1712,690nt,11621nt

两株,盖塔病毒,全基因组序列,序列测定,分子遗传进化,海南省,省分,M1,分子差异,进化特征,基因扩增,病毒基因组,基因组数据,生物信息学软件,分子特征,遗传进化分析,基因组全长,甲病毒,基因组结构,结构基因,连接区,完全相同,非编码区,毒株,UTR,重复序列,同源性分析,进化簇,南首,海南岛,蚊虫标本,进化分支,数千公里,分离株,进化关系,大分子,遗传差异,人畜共患病

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