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北京市2018—2020年疱疹性咽颊炎相关CV-A6分子流行病学特征分析
文献摘要:
目的:了解北京市2018—2020年疱疹性咽颊炎(herpangina,HA)相关柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)分子流行病学特征。方法:收集2018—2020年北京市16个区哨点监测医院中就诊的18岁以下HA病例的基本信息及临床症状,利用real-time RT-PCR方法检测肠道病毒(enterovirus,EV)和CV-A6核酸,采用描述性统计方法分析HA病例流行特征。扩增CV-A6 VP1区并测序,采用IQ-tree软件进行最大似然法进行系统进化树的重建,对序列进行遗传进化分析。结果:2018—2020年共收集HA病例2 937例,EV阳性1 373例,总阳性率为46.75%,其中CV-A6阳性占总阳性病例的29.42%(404/1 373)。在CV-A6阳性病例中,性别比为1.08:1,发病高峰为秋季,主要症状为疱疹(93.32%,377/404)、发热(86.39%,349/404),全部为轻症病例。本研究新定义了CV-A6的E基因型,所测89条CV-A6全长VP1核苷酸序列进行的遗传进化和核苷酸相似度分析发现,均属于D3基因亚型。结论:CV-A6是2018—2020年北京地区疱疹性咽颊炎主要病原之一,主要流行株为D3亚型。应开展HA病例的常规监测,及时分析CV-A6的分子进化特征。
文献关键词:
疱疹性咽颊炎;肠道病毒;CV-A6;基因型;进化
中图分类号:
作者姓名:
梁志超;李仁清;林长缨;李洁;杨扬;霍达;董帅兵;刘芬
作者机构:
首都医科大学公共卫生学院,北京 100069;北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所 100013;北京市疾病预防控制中心性病艾滋病防治所 100013
文献出处:
引用格式:
[1]梁志超;李仁清;林长缨;李洁;杨扬;霍达;董帅兵;刘芬-.北京市2018—2020年疱疹性咽颊炎相关CV-A6分子流行病学特征分析)[J].国际病毒学杂志,2022(01):23-29
A类:
herpangina
B类:
疱疹性咽颊炎,CV,A6,分子流行病学,流行病学特征分析,HA,柯萨奇病毒,coxsackievirus,哨点监测,院中,real,肠道病毒,enterovirus,EV,描述性统计,统计方法,流行特征,VP1,IQ,tree,最大似然法,系统进化树,遗传进化分析,共收,阳性病例,性别比,发病高峰,主要症状,轻症,新定义,基因型,全长,相似度分析,D3,基因亚型,北京地区,主要病原,主要流行株,常规监测,分子进化,进化特征
AB值:
0.306341
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