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SARS-CoV-2棘突蛋白H146Y突变的逆转录重组酶介导的等温扩增方法建立
文献摘要：
目的:基于逆转录重组酶介导的恒温扩增（reverse transcriptional recombinase aided amplification，RT-RAA）技术，建立一种快速，灵敏，简便的SARS-CoV-2棘突蛋白（S）H146Y突变检测方法。方法:针对SARS-CoV-2棘突蛋白H146Y突变区域设计RT-RAA特异性引物和荧光探针，使用优化的RT-RAA方法进行恒温扩增检测，评价方法的灵敏度和特异性，并与二代测序技术进行比较。结果:基于荧光信号的RT-RAA方法能在39 ℃，30 min完成检测，SARS-CoV-2 S蛋白H146（S-H146）野生株和Y146（S-Y146）突变株检测限均为10 copies/μL，能够依据荧光值明显区分S-H146毒株与S-Y146毒株的重组质粒或临床样本，且和五种常见呼吸道感染病毒无交叉反应，与二代测序技术方法一致性高。结论:建立的RT-RAA荧光检测方法具有灵敏度高，特异性强，适用于SARS-CoV-2 S蛋白H146Y突变株的快速检测，为基层医疗机构提供了新的鉴定方法。
文献关键词：
RT-RAA;SARS-CoV-2;棘突蛋白;突变;分子检测
中图分类号：
作者姓名：
郭悦;安柏霖;刘丹丹;罗君红;赵康辰;朱小娟;葛以跃;吴宏斌;崔仑标
作者机构：
南京医科大学 210029;南开大学药学院 天津国际生物医药联合研究院 300071;江苏省疾病预防控制中心国家卫生健康委员会肠道病原微生物重点实验室，南京 210009;泰州医药城医学检验有限公司，泰州 225300
文献出处：
引用格式：
[1]郭悦;安柏霖;刘丹丹;罗君红;赵康辰;朱小娟;葛以跃;吴宏斌;崔仑标-.SARS-CoV-2棘突蛋白H146Y突变的逆转录重组酶介导的等温扩增方法建立)[J].国际病毒学杂志,2022(04):292-297
A类：
H146Y,H146,Y146
B类：
SARS,CoV,棘突蛋白,逆转录,重组酶介导的等温扩增,增方,恒温扩增,reverse,transcriptional,recombinase,aided,amplification,RAA,突变检测,区域设计,特异性引物,荧光探针,使用优化,二代测序技术,荧光信号,野生株,突变株,检测限,copies,荧光值,毒株,重组质粒,临床样本,呼吸道感染,感染病,交叉反应,荧光检测,灵敏度高,快速检测,基层医疗机构,鉴定方法,分子检测
AB值：
0.293291
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