典型文献
2019-2020年深圳市大鹏新区柯萨奇病毒A6型流行及其VP1基因特征分析
文献摘要:
目的 了解2019-2020年深圳市大鹏新区手足口病(hand-foot-mouthdisease,HFMD)病例中柯萨奇病毒A6型(CVA6)流行情况及VP1区基因特征,为HFMD的预防和控制提供科学依据.方法 收集临床诊断为HFMD病人的肛拭样本,采用实时荧光RT-PCR方法检测病毒核酸,以RT-PCR法扩增CVA6VP1全长基因并测序,利用生物信息软件在分子水平分析毒株的进化特征.结果 在检出的156份肠道病毒阳性样本中,CVA16、CVA6、CVA10阳性率分别为4.49%、83.33%、3.21%,8.97%未能分型.其中15株CVA6分离毒株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为91.85%~99.86%和85.81%~100.00%.系统进化树显示,15株CVA6位于同一分支,均属于D基因型中的D3基因亚型,与2018年黑龙江分离株MN845847、长春分离株MN845816、2015年上海分离株KX064297和2017年广东分离株MN845823进化关系较近,而与CVA6原型株Gdula进化距离较远.结论 2019-2020年深圳市大鹏新区HFMD病原CVA6型为绝对优势流行毒株,应加强对非EV71型、非CVA16型等其它肠道病毒监测.
文献关键词:
手足口病;CVA6;序列分析;VP1基因;进化分析
中图分类号:
作者姓名:
王文祥;连宪强;范秋华
作者机构:
广东省深圳市大鹏新区疾病预防控制中心微生物检验科,广东深圳518116
文献出处:
引用格式:
[1]王文祥;连宪强;范秋华-.2019-2020年深圳市大鹏新区柯萨奇病毒A6型流行及其VP1基因特征分析)[J].河南预防医学杂志,2022(07):496-498,502
A类:
mouthdisease,CVA6VP1,MN845847,MN845816,KX064297,MN845823,Gdula
B类:
深圳市大鹏新区,柯萨奇病毒,基因特征分析,手足口病,hand,foot,HFMD,流行情况,预防和控制,病毒核酸,全长,利用生物,生物信息软件,分子水平,水平分析,进化特征,肠道病毒,病毒阳性,阳性样本,CVA16,CVA10,氨基酸序列,序列同源性,系统进化树,基因型,D3,基因亚型,分离株,长春,春分,进化关系,进化距离,较远,绝对优势,优势流,流行毒株,EV71,序列分析,进化分析
AB值:
0.289141
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。