典型文献
生物信息学分析干扰素信号通路在神经母细胞瘤远处转移中的作用
文献摘要：
目的:通过生物信息学分析,确定神经母细胞瘤转移相关的枢纽基因,并探究其在转移与预后中发挥的作用.方法:从GEO数据库下载包含神经母细胞瘤原发灶与转移灶的基因芯片原始数据,筛选差异表达基因并进行GO与KEGG富集分析,在STRING数据库中构建蛋白质互作用网络,在Cytoscape中筛选枢纽基因,并通过外部数据集进行验证.此外,在R2平台上对枢纽基因进行生存分析.构建加权基因共表达网络筛选转移相关的模块.结果:共有320个差异表达基因,其中上调162个,下调158个.10个枢纽基因分别是IFI44L、IFI44、HERC5、HERC6、USP18、DDX60、ISG15、RSAD2、MX1、MX2.干扰素信号通路相关基因在转移性神经母细胞瘤中表达差异显著.结论:生物信息学分析为神经母细胞瘤转移的机制提供了新的视角.干扰素信号通路相关基因有望成为诊断标志物及治疗靶点.
文献关键词：
神经母细胞瘤;远处转移;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
王捷频;张雨婷;肖东
作者机构：
汕头大学医学院,广东 汕头 515041;深圳市儿童医院,广东 深圳 518000;汕头大学医学院第一附属医院,广东 汕头 515041
文献出处：
引用格式：
[1]王捷频;张雨婷;肖东-.生物信息学分析干扰素信号通路在神经母细胞瘤远处转移中的作用)[J].汕头大学医学院学报,2022(04):198-203
A类：
HERC6
B类：
生物信息学分析,干扰素信号通路,神经母细胞瘤,远处转移,定神,移相,枢纽基因,GEO,下载,原发灶,转移灶,基因芯片,原始数据,差异表达基因,富集分析,STRING,Cytoscape,外部数据,生存分析,加权基因共表达网络,IFI44L,HERC5,USP18,DDX60,ISG15,RSAD2,MX1,MX2,转移性,表达差异,诊断标志物,治疗靶点
AB值：
0.322752
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