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滑皮金柑全长转录组测序分析
文献摘要：
滑皮金柑(Fortunella crassifolia Swingle)为我国重要的柑橘类水果之一,为获得其完整的遗传信息,我们采用PacBio单细胞长链测序技术对滑皮金柑进行全长转录组测序,总获得13.81 G原始数据.经处理得到12 040个全长转录本,其中已知转录本为5 033个,已知基因的新转录本为5 589个,新基因转录本为1 418个,确定的新转录本占比为58％.全长转录本对应于6 984个基因,其中878个为新基因.经结构分析发现3 031个基因发生了可变剪切事件,占比为43.4％;6 106个基因至少含有一个poly(A)位点,且其中含有2个和2个以上的poly(A)位点的基因占比为42.3％;596个转录因子分布于82个转录因子家族;360个LncRNA序列和75个融合基因.通过对PacBio数据的进一步挖掘,该研究还发现了 6个抗病基因,为滑皮金柑的抗病品种培育打下基础.
文献关键词：
滑皮金柑;全长转录组;多聚腺苷酸化;融合基因;抗病基因
中图分类号：
作者姓名：
李智龙;熊志伟;尹辉;高玉霞
作者机构：
赣南师范大学 生命科学学院 江西赣州 341000;赣南师范大学 国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000
文献出处：
引用格式：
[1]李智龙;熊志伟;尹辉;高玉霞-.滑皮金柑全长转录组测序分析)[J].赣南师范大学学报,2022(06):72-76
A类：
B类：
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AB值：
0.30355
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