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基于二代测序的口咽癌HPV-16病毒整合位点检测新方法的建立与应用
文献摘要：
目的:构建一个基于二代测序的口咽癌HPV-16病毒整合位点检测新方法,明确建库条件和流程,评估测序结果和质量,为口咽癌临床诊疗提供技术手段和理论支持.方法:对HPV-16阳性的口咽癌细胞UM-SCC-47以及5对临床标本利用多重PCR方法进行DNA建库和测序,评估测序深度及偏倚性,对测序数据进行分析,找出HPV-16整合位点所在基因.结果:成功构建了测序体系,可在96孔板中批量实现并于12小时内完成.石蜡包埋组织与新鲜组织测序质量并无差异.分析得到HPV-16整合位点所在的19个基因.结论:一个基于二代测序的口咽癌HPV-16整合位点检测新方法已成功构建.该方法建库时间短,成本低,测序深度有保证,方便应用和推广.
文献关键词：
HPV;口咽癌;二代测序;整合位点
中图分类号：
作者姓名：
赵霞;刘鹏;王嘉正;张绍明;欧兰香;陈翰祥
作者机构：
山东第一医科大学第一附属医院(山东省千佛山医院)检验科,山东济南 250014;山东莱博生物科技有限公司,山东济南 250000
文献出处：
引用格式：
[1]赵霞;刘鹏;王嘉正;张绍明;欧兰香;陈翰祥-.基于二代测序的口咽癌HPV-16病毒整合位点检测新方法的建立与应用)[J].医学检验与临床,2022(05):1-5
A类：
B类：
二代测序,口咽癌,HPV,病毒整合,整合位点,点检,建立与应用,建库,估测,临床诊疗,癌细胞,UM,SCC,临床标本,本利,偏倚性,序数,孔板,石蜡包埋,新鲜组织
AB值：
0.2642
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