典型文献
肝癌相关hsa-miR-483-5p的靶基因预测及生物信息学分析
文献摘要：
目的 通过生物信息学分析方法预测miR-483-5p的靶基因和信号通路,为进一步分析其在肝癌发生、发展中的调控机制提供理论依据.方法 利用starBase靶基因数据库预测hsa-miR-483-5p靶基因集,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建miRNA潜在靶点蛋白质相互作用(PPI)网络图,再将预测的靶基因利用软件R3.6.3进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果 hsa-miR-483-5p预测的靶基因一共278个.GO功能富集分析结果显示,hsa-miR-483-5p的靶基因主要富集在细胞的焦点粘连、细胞基质黏着小带、细胞-基质结等细胞组分;参与蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性等分子功能(P值均＜0.05).KEGG信号通路富集分析表明,hsa-miR-483-5p的靶基因信号通路显著富集在焦点粘连通路和胰岛素信号通路(P值均＜0.05).其中,MAPK1和MAPK3同时出现在所有的细胞组分、分子功能和信号通路中,处于信号转导网络的核心位置.结论 hsa-miR-483-5p可能通过靶基因参与多种生物学过程,推测其在肝癌中的作用可能与MAPK1和MAPK3的调控密切相关.
文献关键词：
肝癌(HCC);hsa-miR-483-5p;生物信息;靶基因
中图分类号：
作者姓名：
胡莉萍;王学燕;陈钦艳;张陆娟;蒋智华
作者机构：
广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室,广西南宁530028
文献出处：
引用格式：
[1]胡莉萍;王学燕;陈钦艳;张陆娟;蒋智华-.肝癌相关hsa-miR-483-5p的靶基因预测及生物信息学分析)[J].应用预防医学,2022(02):102-106
A类：
B类：
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AB值：
0.299251
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