典型文献
顺铂诱导急性肾损伤差异基因的分析和鉴定
文献摘要：
目的:分析与鉴定顺铂诱导急性肾损伤(Cisplatin induced acute kidney injury,Cis-AKI)的关键差异基因.方法:选取公共基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中Cis-AKI大鼠的微阵列测序数据集进行分析,通过R软件中的limma包分析Cis-AKI的差异基因(Differentially expressed genes,DEGs),对差异基因进行基因的本体论(Gene Ontology,GO)分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.使用MCODE模块和CytoHubba模块筛选蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI)中的关键差异基因.结果:与对照组相比,Cis-AKI组共有119个DEGs,其中上调基因62个,下调基因57个.DEGs主要富集在细胞周期和昼夜节律等通路上.ARNTL、CLOCK、CRY1、DBP、PER3、NR1D1、CCNG1、FOS、BTG2和AEN基因被鉴定为是Cis-AKI中的关键差异基因.这些关键差异基因主要富集在p53信号通路、细胞周期和昼夜节律等相关通路.结论:利用生物信息学方法对Cis-AKI差异表达基因的分析,鉴定出ARNTL、CLOCK、CRY1、DBP、PER3、NR1D1、CCNG1、FOS、BTG2和AEN等基因是Cis-AKI中的关键差异基因.
文献关键词：
顺铂;急性肾损伤;生物信息学;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
韦肖娜;吴剑平;张瑞;李佳佳;甘言刚;杨琼琼
作者机构：
中山大学孙逸仙纪念医院肾内科,中山大学孙逸仙纪念医院医学研究中心 510120
文献出处：
引用格式：
[1]韦肖娜;吴剑平;张瑞;李佳佳;甘言刚;杨琼琼-.顺铂诱导急性肾损伤差异基因的分析和鉴定)[J].岭南急诊医学杂志,2022(02):123-128
A类：
PER3,CCNG1
B类：
顺铂,急性肾损伤,Cisplatin,induced,acute,kidney,injury,AKI,关键差异基因,基因表达数据库,Expression,Omnibus,GEO,微阵列,序数,limma,包分析,Differentially,expressed,genes,DEGs,本体论,Ontology,京都基因与基因组百科全书,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,富集分析,MCODE,CytoHubba,蛋白质互作网络,Protein,Interaction,Networks,PPI,细胞周期,昼夜节律,ARNTL,CLOCK,CRY1,DBP,NR1D1,FOS,BTG2,AEN,p53,相关通路,利用生物,生物信息学方法,差异表达基因
AB值：
0.344795
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